Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSR3Q9UJK0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TSR3Q9UJK0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSR3Q9UJK0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSR3Q9UJK0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
TSR3Q9UJK0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSR3Q9UJK0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSR3Q9UJK0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSR3Q9UJK0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSR3Q9UJK0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSR3Q9UJK0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSR3Q9UJK0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSR3Q9UJK0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSR3Q9UJK0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSR3Q9UJK0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSR3Q9UJK0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TSR3Q9UJK0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TSR3Q9UJK0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSR3Q9UJK0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSR3Q9UJK0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSR3Q9UJK0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSR3Q9UJK0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSR3Q9UJK0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSR3Q9UJK0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSR3Q9UJK0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSR3Q9UJK0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSR3Q9UJK0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSR3Q9UJK0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR3Q9UJK0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR3Q9UJK0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSR3Q9UJK0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSR3Q9UJK0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSR3Q9UJK0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSR3Q9UJK0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSR3Q9UJK0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSR3Q9UJK0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSR3Q9UJK0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSR3Q9UJK0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSR3Q9UJK0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSR3Q9UJK0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR3Q9UJK0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSR3Q9UJK0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSR3Q9UJK0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSR3Q9UJK0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSR3Q9UJK0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSR3Q9UJK0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR3Q9UJK0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSR3Q9UJK0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TSR3Q9UJK0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSR3Q9UJK0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSR3Q9UJK0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSR3Q9UJK0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSR3Q9UJK0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSR3Q9UJK0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSR3Q9UJK0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSR3Q9UJK0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSR3Q9UJK0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSR3Q9UJK0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSR3Q9UJK0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TSR3Q9UJK0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSR3Q9UJK0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSR3Q9UJK0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSR3Q9UJK0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSR3Q9UJK0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR3Q9UJK0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR3Q9UJK0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR3Q9UJK0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSR3Q9UJK0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSR3Q9UJK0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSR3Q9UJK0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSR3Q9UJK0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSR3Q9UJK0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSR3Q9UJK0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSR3Q9UJK0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSR3Q9UJK0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSR3Q9UJK0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSR3Q9UJK0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSR3Q9UJK0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSR3Q9UJK0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR3Q9UJK0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSR3Q9UJK0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TSR3Q9UJK0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSR3Q9UJK0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSR3Q9UJK0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TSR3Q9UJK0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSR3Q9UJK0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSR3Q9UJK0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSR3Q9UJK0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSR3Q9UJK0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR3Q9UJK0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSR3Q9UJK0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSR3Q9UJK0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSR3Q9UJK0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSR3Q9UJK0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSR3Q9UJK0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSR3Q9UJK0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSR3Q9UJK0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSR3Q9UJK0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TSR3Q9UJK0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TSR3Q9UJK0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms