Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
STAG3Q9UJ98 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
STAG3Q9UJ98 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
STAG3Q9UJ98 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
STAG3Q9UJ98 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
STAG3Q9UJ98 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
STAG3Q9UJ98 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
STAG3Q9UJ98 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
STAG3Q9UJ98 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
STAG3Q9UJ98 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
STAG3Q9UJ98 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC42.79■■■■■ 4.44
STAG3Q9UJ98 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
STAG3Q9UJ98 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
STAG3Q9UJ98 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
STAG3Q9UJ98 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
STAG3Q9UJ98 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
STAG3Q9UJ98 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
STAG3Q9UJ98 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
STAG3Q9UJ98 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
STAG3Q9UJ98 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
STAG3Q9UJ98 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
STAG3Q9UJ98 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
STAG3Q9UJ98 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
STAG3Q9UJ98 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
STAG3Q9UJ98 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
STAG3Q9UJ98 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
STAG3Q9UJ98 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
STAG3Q9UJ98 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
STAG3Q9UJ98 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC42.34■■■■■ 4.37
STAG3Q9UJ98 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
STAG3Q9UJ98 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
STAG3Q9UJ98 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
STAG3Q9UJ98 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
STAG3Q9UJ98 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
STAG3Q9UJ98 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
STAG3Q9UJ98 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
STAG3Q9UJ98 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
STAG3Q9UJ98 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
STAG3Q9UJ98 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
STAG3Q9UJ98 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
STAG3Q9UJ98 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
STAG3Q9UJ98 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
STAG3Q9UJ98 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
STAG3Q9UJ98 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
STAG3Q9UJ98 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
STAG3Q9UJ98 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
STAG3Q9UJ98 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
STAG3Q9UJ98 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
STAG3Q9UJ98 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
STAG3Q9UJ98 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
STAG3Q9UJ98 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
STAG3Q9UJ98 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
STAG3Q9UJ98 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
STAG3Q9UJ98 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
STAG3Q9UJ98 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
STAG3Q9UJ98 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
STAG3Q9UJ98 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
STAG3Q9UJ98 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
STAG3Q9UJ98 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
STAG3Q9UJ98 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
STAG3Q9UJ98 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
STAG3Q9UJ98 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
STAG3Q9UJ98 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
STAG3Q9UJ98 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
STAG3Q9UJ98 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
STAG3Q9UJ98 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
STAG3Q9UJ98 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
STAG3Q9UJ98 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
STAG3Q9UJ98 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
STAG3Q9UJ98 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
STAG3Q9UJ98 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
STAG3Q9UJ98 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
STAG3Q9UJ98 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
STAG3Q9UJ98 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
STAG3Q9UJ98 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
STAG3Q9UJ98 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
STAG3Q9UJ98 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
STAG3Q9UJ98 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
STAG3Q9UJ98 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
STAG3Q9UJ98 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.36■■■■■ 4.21
STAG3Q9UJ98 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
STAG3Q9UJ98 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
STAG3Q9UJ98 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
STAG3Q9UJ98 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
STAG3Q9UJ98 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
STAG3Q9UJ98 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
STAG3Q9UJ98 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
STAG3Q9UJ98 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
STAG3Q9UJ98 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
STAG3Q9UJ98 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
STAG3Q9UJ98 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
STAG3Q9UJ98 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
STAG3Q9UJ98 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
STAG3Q9UJ98 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
STAG3Q9UJ98 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
STAG3Q9UJ98 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
STAG3Q9UJ98 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
STAG3Q9UJ98 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
STAG3Q9UJ98 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
STAG3Q9UJ98 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms