Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL1

SCOC, Short coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCOCQ9UIL1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCOCQ9UIL1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCOCQ9UIL1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCOCQ9UIL1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCOCQ9UIL1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCOCQ9UIL1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCOCQ9UIL1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCOCQ9UIL1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCOCQ9UIL1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCOCQ9UIL1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCOCQ9UIL1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCOCQ9UIL1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCOCQ9UIL1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCOCQ9UIL1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCOCQ9UIL1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCOCQ9UIL1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCOCQ9UIL1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCOCQ9UIL1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCOCQ9UIL1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCOCQ9UIL1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCOCQ9UIL1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCOCQ9UIL1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCOCQ9UIL1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCOCQ9UIL1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCOCQ9UIL1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCOCQ9UIL1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCOCQ9UIL1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCOCQ9UIL1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCOCQ9UIL1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCOCQ9UIL1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCOCQ9UIL1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCOCQ9UIL1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCOCQ9UIL1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCOCQ9UIL1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCOCQ9UIL1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCOCQ9UIL1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCOCQ9UIL1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCOCQ9UIL1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SCOCQ9UIL1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCOCQ9UIL1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCOCQ9UIL1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCOCQ9UIL1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCOCQ9UIL1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCOCQ9UIL1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCOCQ9UIL1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCOCQ9UIL1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCOCQ9UIL1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCOCQ9UIL1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCOCQ9UIL1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCOCQ9UIL1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCOCQ9UIL1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCOCQ9UIL1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCOCQ9UIL1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCOCQ9UIL1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCOCQ9UIL1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCOCQ9UIL1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCOCQ9UIL1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCOCQ9UIL1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCOCQ9UIL1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCOCQ9UIL1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCOCQ9UIL1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCOCQ9UIL1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCOCQ9UIL1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCOCQ9UIL1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCOCQ9UIL1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCOCQ9UIL1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCOCQ9UIL1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCOCQ9UIL1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCOCQ9UIL1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCOCQ9UIL1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCOCQ9UIL1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCOCQ9UIL1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCOCQ9UIL1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCOCQ9UIL1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCOCQ9UIL1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCOCQ9UIL1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCOCQ9UIL1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCOCQ9UIL1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCOCQ9UIL1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCOCQ9UIL1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCOCQ9UIL1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SCOCQ9UIL1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCOCQ9UIL1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCOCQ9UIL1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCOCQ9UIL1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCOCQ9UIL1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCOCQ9UIL1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCOCQ9UIL1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCOCQ9UIL1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SCOCQ9UIL1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCOCQ9UIL1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCOCQ9UIL1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCOCQ9UIL1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCOCQ9UIL1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCOCQ9UIL1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCOCQ9UIL1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCOCQ9UIL1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCOCQ9UIL1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCOCQ9UIL1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCOCQ9UIL1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms