Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS4

DNAJB11, DnaJ homolog subfamily B member 11, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB11Q9UBS4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJB11Q9UBS4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJB11Q9UBS4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJB11Q9UBS4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJB11Q9UBS4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJB11Q9UBS4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJB11Q9UBS4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJB11Q9UBS4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJB11Q9UBS4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJB11Q9UBS4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJB11Q9UBS4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJB11Q9UBS4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJB11Q9UBS4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJB11Q9UBS4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJB11Q9UBS4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJB11Q9UBS4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJB11Q9UBS4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJB11Q9UBS4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJB11Q9UBS4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB11Q9UBS4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB11Q9UBS4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJB11Q9UBS4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJB11Q9UBS4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJB11Q9UBS4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJB11Q9UBS4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJB11Q9UBS4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJB11Q9UBS4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJB11Q9UBS4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJB11Q9UBS4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJB11Q9UBS4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJB11Q9UBS4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJB11Q9UBS4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJB11Q9UBS4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJB11Q9UBS4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJB11Q9UBS4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJB11Q9UBS4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJB11Q9UBS4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJB11Q9UBS4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJB11Q9UBS4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJB11Q9UBS4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNAJB11Q9UBS4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJB11Q9UBS4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJB11Q9UBS4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJB11Q9UBS4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJB11Q9UBS4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJB11Q9UBS4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJB11Q9UBS4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJB11Q9UBS4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB11Q9UBS4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB11Q9UBS4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB11Q9UBS4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJB11Q9UBS4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJB11Q9UBS4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJB11Q9UBS4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJB11Q9UBS4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJB11Q9UBS4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJB11Q9UBS4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB11Q9UBS4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB11Q9UBS4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJB11Q9UBS4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJB11Q9UBS4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJB11Q9UBS4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJB11Q9UBS4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJB11Q9UBS4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJB11Q9UBS4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJB11Q9UBS4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJB11Q9UBS4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJB11Q9UBS4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJB11Q9UBS4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJB11Q9UBS4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJB11Q9UBS4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNAJB11Q9UBS4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJB11Q9UBS4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJB11Q9UBS4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJB11Q9UBS4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAJB11Q9UBS4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAJB11Q9UBS4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAJB11Q9UBS4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAJB11Q9UBS4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAJB11Q9UBS4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAJB11Q9UBS4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAJB11Q9UBS4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAJB11Q9UBS4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJB11Q9UBS4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJB11Q9UBS4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJB11Q9UBS4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJB11Q9UBS4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJB11Q9UBS4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJB11Q9UBS4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJB11Q9UBS4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJB11Q9UBS4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJB11Q9UBS4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJB11Q9UBS4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJB11Q9UBS4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJB11Q9UBS4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJB11Q9UBS4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJB11Q9UBS4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJB11Q9UBS4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJB11Q9UBS4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJB11Q9UBS4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms