Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPZ2Q9P299 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPZ2Q9P299 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPZ2Q9P299 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPZ2Q9P299 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPZ2Q9P299 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPZ2Q9P299 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPZ2Q9P299 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPZ2Q9P299 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPZ2Q9P299 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPZ2Q9P299 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPZ2Q9P299 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPZ2Q9P299 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPZ2Q9P299 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPZ2Q9P299 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPZ2Q9P299 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COPZ2Q9P299 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPZ2Q9P299 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPZ2Q9P299 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPZ2Q9P299 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPZ2Q9P299 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPZ2Q9P299 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COPZ2Q9P299 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COPZ2Q9P299 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPZ2Q9P299 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPZ2Q9P299 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPZ2Q9P299 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPZ2Q9P299 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COPZ2Q9P299 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPZ2Q9P299 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPZ2Q9P299 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPZ2Q9P299 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPZ2Q9P299 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPZ2Q9P299 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPZ2Q9P299 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPZ2Q9P299 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPZ2Q9P299 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPZ2Q9P299 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPZ2Q9P299 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPZ2Q9P299 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPZ2Q9P299 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPZ2Q9P299 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPZ2Q9P299 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPZ2Q9P299 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPZ2Q9P299 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPZ2Q9P299 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COPZ2Q9P299 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPZ2Q9P299 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPZ2Q9P299 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPZ2Q9P299 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPZ2Q9P299 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPZ2Q9P299 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPZ2Q9P299 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPZ2Q9P299 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPZ2Q9P299 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPZ2Q9P299 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPZ2Q9P299 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPZ2Q9P299 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COPZ2Q9P299 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPZ2Q9P299 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPZ2Q9P299 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPZ2Q9P299 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPZ2Q9P299 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPZ2Q9P299 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPZ2Q9P299 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPZ2Q9P299 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPZ2Q9P299 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPZ2Q9P299 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPZ2Q9P299 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPZ2Q9P299 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPZ2Q9P299 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPZ2Q9P299 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPZ2Q9P299 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPZ2Q9P299 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPZ2Q9P299 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPZ2Q9P299 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPZ2Q9P299 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPZ2Q9P299 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPZ2Q9P299 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPZ2Q9P299 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPZ2Q9P299 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPZ2Q9P299 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPZ2Q9P299 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPZ2Q9P299 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPZ2Q9P299 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPZ2Q9P299 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPZ2Q9P299 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPZ2Q9P299 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPZ2Q9P299 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPZ2Q9P299 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPZ2Q9P299 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPZ2Q9P299 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPZ2Q9P299 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPZ2Q9P299 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPZ2Q9P299 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPZ2Q9P299 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPZ2Q9P299 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPZ2Q9P299 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPZ2Q9P299 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPZ2Q9P299 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms