Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M9

MRPL27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL27Q9P0M9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL27Q9P0M9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL27Q9P0M9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL27Q9P0M9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL27Q9P0M9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL27Q9P0M9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL27Q9P0M9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL27Q9P0M9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL27Q9P0M9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL27Q9P0M9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL27Q9P0M9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL27Q9P0M9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL27Q9P0M9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL27Q9P0M9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL27Q9P0M9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL27Q9P0M9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL27Q9P0M9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL27Q9P0M9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL27Q9P0M9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL27Q9P0M9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL27Q9P0M9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL27Q9P0M9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL27Q9P0M9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL27Q9P0M9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL27Q9P0M9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL27Q9P0M9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL27Q9P0M9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL27Q9P0M9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL27Q9P0M9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL27Q9P0M9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL27Q9P0M9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL27Q9P0M9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL27Q9P0M9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL27Q9P0M9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL27Q9P0M9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL27Q9P0M9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL27Q9P0M9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL27Q9P0M9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL27Q9P0M9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL27Q9P0M9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL27Q9P0M9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL27Q9P0M9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL27Q9P0M9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL27Q9P0M9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL27Q9P0M9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL27Q9P0M9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL27Q9P0M9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL27Q9P0M9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL27Q9P0M9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL27Q9P0M9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL27Q9P0M9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL27Q9P0M9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL27Q9P0M9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL27Q9P0M9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL27Q9P0M9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL27Q9P0M9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL27Q9P0M9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL27Q9P0M9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL27Q9P0M9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL27Q9P0M9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL27Q9P0M9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL27Q9P0M9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL27Q9P0M9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL27Q9P0M9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL27Q9P0M9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL27Q9P0M9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRPL27Q9P0M9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPL27Q9P0M9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL27Q9P0M9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL27Q9P0M9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL27Q9P0M9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL27Q9P0M9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL27Q9P0M9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL27Q9P0M9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL27Q9P0M9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL27Q9P0M9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL27Q9P0M9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL27Q9P0M9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL27Q9P0M9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL27Q9P0M9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL27Q9P0M9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL27Q9P0M9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL27Q9P0M9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL27Q9P0M9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL27Q9P0M9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL27Q9P0M9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL27Q9P0M9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL27Q9P0M9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL27Q9P0M9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL27Q9P0M9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL27Q9P0M9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL27Q9P0M9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL27Q9P0M9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL27Q9P0M9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL27Q9P0M9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL27Q9P0M9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL27Q9P0M9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL27Q9P0M9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL27Q9P0M9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL27Q9P0M9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms