Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY12

GAR1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAR1Q9NY12 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GAR1Q9NY12 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GAR1Q9NY12 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAR1Q9NY12 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAR1Q9NY12 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAR1Q9NY12 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAR1Q9NY12 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAR1Q9NY12 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAR1Q9NY12 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GAR1Q9NY12 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GAR1Q9NY12 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GAR1Q9NY12 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GAR1Q9NY12 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAR1Q9NY12 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAR1Q9NY12 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GAR1Q9NY12 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAR1Q9NY12 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAR1Q9NY12 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GAR1Q9NY12 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAR1Q9NY12 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GAR1Q9NY12 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAR1Q9NY12 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAR1Q9NY12 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAR1Q9NY12 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAR1Q9NY12 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAR1Q9NY12 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAR1Q9NY12 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAR1Q9NY12 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAR1Q9NY12 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAR1Q9NY12 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GAR1Q9NY12 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAR1Q9NY12 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GAR1Q9NY12 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAR1Q9NY12 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAR1Q9NY12 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAR1Q9NY12 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAR1Q9NY12 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAR1Q9NY12 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GAR1Q9NY12 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAR1Q9NY12 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAR1Q9NY12 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAR1Q9NY12 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAR1Q9NY12 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAR1Q9NY12 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAR1Q9NY12 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAR1Q9NY12 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAR1Q9NY12 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAR1Q9NY12 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAR1Q9NY12 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAR1Q9NY12 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAR1Q9NY12 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAR1Q9NY12 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAR1Q9NY12 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAR1Q9NY12 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAR1Q9NY12 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAR1Q9NY12 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAR1Q9NY12 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GAR1Q9NY12 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GAR1Q9NY12 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAR1Q9NY12 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAR1Q9NY12 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAR1Q9NY12 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAR1Q9NY12 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAR1Q9NY12 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAR1Q9NY12 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GAR1Q9NY12 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAR1Q9NY12 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAR1Q9NY12 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAR1Q9NY12 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAR1Q9NY12 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAR1Q9NY12 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAR1Q9NY12 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAR1Q9NY12 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GAR1Q9NY12 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAR1Q9NY12 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAR1Q9NY12 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAR1Q9NY12 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAR1Q9NY12 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAR1Q9NY12 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAR1Q9NY12 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAR1Q9NY12 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAR1Q9NY12 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAR1Q9NY12 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAR1Q9NY12 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAR1Q9NY12 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAR1Q9NY12 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAR1Q9NY12 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GAR1Q9NY12 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAR1Q9NY12 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAR1Q9NY12 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAR1Q9NY12 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAR1Q9NY12 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAR1Q9NY12 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAR1Q9NY12 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAR1Q9NY12 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAR1Q9NY12 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAR1Q9NY12 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAR1Q9NY12 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAR1Q9NY12 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAR1Q9NY12 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms