Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VPS45Q9NRW7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VPS45Q9NRW7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VPS45Q9NRW7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VPS45Q9NRW7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VPS45Q9NRW7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VPS45Q9NRW7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VPS45Q9NRW7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VPS45Q9NRW7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VPS45Q9NRW7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VPS45Q9NRW7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VPS45Q9NRW7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS45Q9NRW7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS45Q9NRW7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VPS45Q9NRW7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VPS45Q9NRW7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VPS45Q9NRW7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VPS45Q9NRW7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VPS45Q9NRW7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VPS45Q9NRW7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VPS45Q9NRW7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VPS45Q9NRW7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VPS45Q9NRW7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS45Q9NRW7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS45Q9NRW7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS45Q9NRW7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS45Q9NRW7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS45Q9NRW7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VPS45Q9NRW7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VPS45Q9NRW7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
VPS45Q9NRW7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
VPS45Q9NRW7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS45Q9NRW7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS45Q9NRW7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VPS45Q9NRW7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VPS45Q9NRW7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VPS45Q9NRW7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VPS45Q9NRW7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VPS45Q9NRW7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS45Q9NRW7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS45Q9NRW7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS45Q9NRW7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS45Q9NRW7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS45Q9NRW7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS45Q9NRW7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS45Q9NRW7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS45Q9NRW7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS45Q9NRW7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS45Q9NRW7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS45Q9NRW7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS45Q9NRW7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS45Q9NRW7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS45Q9NRW7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VPS45Q9NRW7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS45Q9NRW7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS45Q9NRW7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS45Q9NRW7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS45Q9NRW7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS45Q9NRW7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS45Q9NRW7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS45Q9NRW7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS45Q9NRW7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS45Q9NRW7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS45Q9NRW7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS45Q9NRW7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS45Q9NRW7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS45Q9NRW7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS45Q9NRW7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS45Q9NRW7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS45Q9NRW7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS45Q9NRW7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VPS45Q9NRW7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VPS45Q9NRW7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VPS45Q9NRW7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS45Q9NRW7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS45Q9NRW7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS45Q9NRW7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS45Q9NRW7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
VPS45Q9NRW7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS45Q9NRW7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS45Q9NRW7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS45Q9NRW7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS45Q9NRW7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS45Q9NRW7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS45Q9NRW7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS45Q9NRW7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS45Q9NRW7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS45Q9NRW7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS45Q9NRW7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS45Q9NRW7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS45Q9NRW7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS45Q9NRW7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS45Q9NRW7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS45Q9NRW7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS45Q9NRW7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS45Q9NRW7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS45Q9NRW7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS45Q9NRW7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS45Q9NRW7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS45Q9NRW7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.5 ms