Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB16Q9NRJ7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB16Q9NRJ7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB16Q9NRJ7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB16Q9NRJ7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB16Q9NRJ7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB16Q9NRJ7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB16Q9NRJ7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB16Q9NRJ7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB16Q9NRJ7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB16Q9NRJ7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB16Q9NRJ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB16Q9NRJ7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB16Q9NRJ7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB16Q9NRJ7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB16Q9NRJ7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB16Q9NRJ7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB16Q9NRJ7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB16Q9NRJ7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB16Q9NRJ7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB16Q9NRJ7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB16Q9NRJ7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB16Q9NRJ7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB16Q9NRJ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB16Q9NRJ7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB16Q9NRJ7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB16Q9NRJ7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB16Q9NRJ7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB16Q9NRJ7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB16Q9NRJ7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB16Q9NRJ7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB16Q9NRJ7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB16Q9NRJ7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB16Q9NRJ7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB16Q9NRJ7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB16Q9NRJ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB16Q9NRJ7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB16Q9NRJ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB16Q9NRJ7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB16Q9NRJ7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB16Q9NRJ7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB16Q9NRJ7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB16Q9NRJ7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB16Q9NRJ7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB16Q9NRJ7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB16Q9NRJ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB16Q9NRJ7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB16Q9NRJ7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB16Q9NRJ7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB16Q9NRJ7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB16Q9NRJ7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB16Q9NRJ7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB16Q9NRJ7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB16Q9NRJ7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB16Q9NRJ7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB16Q9NRJ7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB16Q9NRJ7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB16Q9NRJ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB16Q9NRJ7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB16Q9NRJ7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB16Q9NRJ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB16Q9NRJ7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB16Q9NRJ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB16Q9NRJ7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB16Q9NRJ7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB16Q9NRJ7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB16Q9NRJ7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB16Q9NRJ7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB16Q9NRJ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB16Q9NRJ7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB16Q9NRJ7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB16Q9NRJ7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB16Q9NRJ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB16Q9NRJ7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB16Q9NRJ7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB16Q9NRJ7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB16Q9NRJ7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB16Q9NRJ7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB16Q9NRJ7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB16Q9NRJ7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB16Q9NRJ7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB16Q9NRJ7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB16Q9NRJ7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB16Q9NRJ7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB16Q9NRJ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB16Q9NRJ7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB16Q9NRJ7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB16Q9NRJ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB16Q9NRJ7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB16Q9NRJ7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB16Q9NRJ7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB16Q9NRJ7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB16Q9NRJ7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB16Q9NRJ7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB16Q9NRJ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB16Q9NRJ7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB16Q9NRJ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB16Q9NRJ7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB16Q9NRJ7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms