Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ2

GSN-AS1, Putative uncharacterized protein GSN-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSN-AS1Q9NRJ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSN-AS1Q9NRJ2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSN-AS1Q9NRJ2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSN-AS1Q9NRJ2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSN-AS1Q9NRJ2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSN-AS1Q9NRJ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSN-AS1Q9NRJ2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSN-AS1Q9NRJ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GSN-AS1Q9NRJ2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSN-AS1Q9NRJ2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSN-AS1Q9NRJ2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSN-AS1Q9NRJ2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSN-AS1Q9NRJ2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSN-AS1Q9NRJ2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSN-AS1Q9NRJ2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSN-AS1Q9NRJ2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSN-AS1Q9NRJ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSN-AS1Q9NRJ2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSN-AS1Q9NRJ2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSN-AS1Q9NRJ2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSN-AS1Q9NRJ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSN-AS1Q9NRJ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSN-AS1Q9NRJ2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSN-AS1Q9NRJ2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSN-AS1Q9NRJ2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSN-AS1Q9NRJ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSN-AS1Q9NRJ2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSN-AS1Q9NRJ2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSN-AS1Q9NRJ2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSN-AS1Q9NRJ2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSN-AS1Q9NRJ2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSN-AS1Q9NRJ2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSN-AS1Q9NRJ2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSN-AS1Q9NRJ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSN-AS1Q9NRJ2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSN-AS1Q9NRJ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSN-AS1Q9NRJ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSN-AS1Q9NRJ2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSN-AS1Q9NRJ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSN-AS1Q9NRJ2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSN-AS1Q9NRJ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSN-AS1Q9NRJ2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSN-AS1Q9NRJ2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSN-AS1Q9NRJ2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSN-AS1Q9NRJ2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSN-AS1Q9NRJ2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSN-AS1Q9NRJ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSN-AS1Q9NRJ2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSN-AS1Q9NRJ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSN-AS1Q9NRJ2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSN-AS1Q9NRJ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSN-AS1Q9NRJ2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSN-AS1Q9NRJ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSN-AS1Q9NRJ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSN-AS1Q9NRJ2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSN-AS1Q9NRJ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSN-AS1Q9NRJ2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSN-AS1Q9NRJ2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSN-AS1Q9NRJ2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSN-AS1Q9NRJ2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSN-AS1Q9NRJ2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSN-AS1Q9NRJ2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSN-AS1Q9NRJ2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSN-AS1Q9NRJ2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSN-AS1Q9NRJ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSN-AS1Q9NRJ2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSN-AS1Q9NRJ2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSN-AS1Q9NRJ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSN-AS1Q9NRJ2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSN-AS1Q9NRJ2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSN-AS1Q9NRJ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSN-AS1Q9NRJ2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GSN-AS1Q9NRJ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSN-AS1Q9NRJ2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSN-AS1Q9NRJ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSN-AS1Q9NRJ2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSN-AS1Q9NRJ2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSN-AS1Q9NRJ2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSN-AS1Q9NRJ2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSN-AS1Q9NRJ2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSN-AS1Q9NRJ2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSN-AS1Q9NRJ2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSN-AS1Q9NRJ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSN-AS1Q9NRJ2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSN-AS1Q9NRJ2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSN-AS1Q9NRJ2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSN-AS1Q9NRJ2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSN-AS1Q9NRJ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSN-AS1Q9NRJ2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSN-AS1Q9NRJ2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSN-AS1Q9NRJ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSN-AS1Q9NRJ2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSN-AS1Q9NRJ2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSN-AS1Q9NRJ2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSN-AS1Q9NRJ2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSN-AS1Q9NRJ2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSN-AS1Q9NRJ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSN-AS1Q9NRJ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSN-AS1Q9NRJ2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GSN-AS1Q9NRJ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms