Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALMDQ9NP74 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALMDQ9NP74 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALMDQ9NP74 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALMDQ9NP74 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALMDQ9NP74 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALMDQ9NP74 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PALMDQ9NP74 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PALMDQ9NP74 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PALMDQ9NP74 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALMDQ9NP74 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALMDQ9NP74 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALMDQ9NP74 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALMDQ9NP74 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALMDQ9NP74 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMDQ9NP74 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PALMDQ9NP74 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PALMDQ9NP74 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PALMDQ9NP74 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PALMDQ9NP74 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALMDQ9NP74 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALMDQ9NP74 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALMDQ9NP74 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALMDQ9NP74 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PALMDQ9NP74 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALMDQ9NP74 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALMDQ9NP74 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALMDQ9NP74 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALMDQ9NP74 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALMDQ9NP74 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PALMDQ9NP74 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALMDQ9NP74 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALMDQ9NP74 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALMDQ9NP74 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALMDQ9NP74 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALMDQ9NP74 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALMDQ9NP74 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALMDQ9NP74 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALMDQ9NP74 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALMDQ9NP74 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PALMDQ9NP74 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALMDQ9NP74 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALMDQ9NP74 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALMDQ9NP74 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALMDQ9NP74 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALMDQ9NP74 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALMDQ9NP74 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALMDQ9NP74 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALMDQ9NP74 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALMDQ9NP74 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALMDQ9NP74 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PALMDQ9NP74 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PALMDQ9NP74 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PALMDQ9NP74 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PALMDQ9NP74 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PALMDQ9NP74 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PALMDQ9NP74 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALMDQ9NP74 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALMDQ9NP74 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALMDQ9NP74 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALMDQ9NP74 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALMDQ9NP74 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALMDQ9NP74 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PALMDQ9NP74 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALMDQ9NP74 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALMDQ9NP74 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALMDQ9NP74 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALMDQ9NP74 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALMDQ9NP74 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALMDQ9NP74 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALMDQ9NP74 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALMDQ9NP74 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALMDQ9NP74 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALMDQ9NP74 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALMDQ9NP74 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALMDQ9NP74 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALMDQ9NP74 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALMDQ9NP74 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALMDQ9NP74 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALMDQ9NP74 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALMDQ9NP74 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALMDQ9NP74 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALMDQ9NP74 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PALMDQ9NP74 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALMDQ9NP74 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALMDQ9NP74 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALMDQ9NP74 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALMDQ9NP74 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALMDQ9NP74 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALMDQ9NP74 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALMDQ9NP74 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALMDQ9NP74 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALMDQ9NP74 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALMDQ9NP74 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PALMDQ9NP74 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALMDQ9NP74 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALMDQ9NP74 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALMDQ9NP74 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PALMDQ9NP74 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALMDQ9NP74 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms