Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW0

BRF2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF2Q9HAW0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BRF2Q9HAW0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BRF2Q9HAW0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BRF2Q9HAW0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BRF2Q9HAW0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRF2Q9HAW0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRF2Q9HAW0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRF2Q9HAW0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRF2Q9HAW0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRF2Q9HAW0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRF2Q9HAW0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRF2Q9HAW0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRF2Q9HAW0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRF2Q9HAW0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRF2Q9HAW0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BRF2Q9HAW0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRF2Q9HAW0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRF2Q9HAW0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRF2Q9HAW0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRF2Q9HAW0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRF2Q9HAW0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRF2Q9HAW0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRF2Q9HAW0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRF2Q9HAW0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRF2Q9HAW0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRF2Q9HAW0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRF2Q9HAW0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRF2Q9HAW0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRF2Q9HAW0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
BRF2Q9HAW0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRF2Q9HAW0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRF2Q9HAW0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRF2Q9HAW0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRF2Q9HAW0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRF2Q9HAW0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRF2Q9HAW0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRF2Q9HAW0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRF2Q9HAW0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRF2Q9HAW0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRF2Q9HAW0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRF2Q9HAW0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRF2Q9HAW0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRF2Q9HAW0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRF2Q9HAW0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRF2Q9HAW0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRF2Q9HAW0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRF2Q9HAW0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRF2Q9HAW0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRF2Q9HAW0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRF2Q9HAW0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRF2Q9HAW0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRF2Q9HAW0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRF2Q9HAW0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRF2Q9HAW0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRF2Q9HAW0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRF2Q9HAW0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRF2Q9HAW0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRF2Q9HAW0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRF2Q9HAW0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRF2Q9HAW0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRF2Q9HAW0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRF2Q9HAW0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRF2Q9HAW0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRF2Q9HAW0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRF2Q9HAW0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRF2Q9HAW0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRF2Q9HAW0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRF2Q9HAW0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRF2Q9HAW0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRF2Q9HAW0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRF2Q9HAW0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF2Q9HAW0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF2Q9HAW0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF2Q9HAW0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF2Q9HAW0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRF2Q9HAW0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRF2Q9HAW0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRF2Q9HAW0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRF2Q9HAW0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRF2Q9HAW0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRF2Q9HAW0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRF2Q9HAW0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRF2Q9HAW0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRF2Q9HAW0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRF2Q9HAW0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRF2Q9HAW0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRF2Q9HAW0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRF2Q9HAW0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRF2Q9HAW0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRF2Q9HAW0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRF2Q9HAW0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRF2Q9HAW0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRF2Q9HAW0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRF2Q9HAW0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRF2Q9HAW0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BRF2Q9HAW0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRF2Q9HAW0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRF2Q9HAW0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRF2Q9HAW0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRF2Q9HAW0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms