Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.052e-15■■■■■ 51.5
CSTF2TQ9H0L4 CNST-201ENST00000366511 645 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.972e-15■■■■■ 51.5
CSTF2TQ9H0L4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.411e-14■■■■■ 51.2
CSTF2TQ9H0L4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.151e-14■■■■■ 51.2
CSTF2TQ9H0L4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.081e-14■■■■■ 51.2
CSTF2TQ9H0L4 PHF20L1-211ENST00000460236 3393 ntTSL 55.14□□□□□ -1.591e-14■■■■■ 51.2
CSTF2TQ9H0L4 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.711e-14■■■■■ 51.2
CSTF2TQ9H0L4 KDM2B-216ENST00000543025 2522 ntTSL 1 (best)15.35■□□□□ 0.055e-15■■■■■ 51.1
CSTF2TQ9H0L4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.125e-15■■■■■ 51.1
CSTF2TQ9H0L4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.195e-15■■■■■ 51.1
CSTF2TQ9H0L4 KDM2B-209ENST00000538503 6676 ntTSL 513.74□□□□□ -0.215e-15■■■■■ 51.1
CSTF2TQ9H0L4 KDM2B-214ENST00000542030 460 ntTSL 413.29□□□□□ -0.285e-15■■■■■ 51.1
CSTF2TQ9H0L4 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.35e-15■■■■■ 51.1
CSTF2TQ9H0L4 KDM2B-203ENST00000446152 1549 ntTSL 512.36□□□□□ -0.435e-15■■■■■ 51.1
CSTF2TQ9H0L4 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.515e-15■■■■■ 51.1
CSTF2TQ9H0L4 KDM2B-212ENST00000541318 600 ntTSL 49.17□□□□□ -0.945e-15■■■■■ 51.1
CSTF2TQ9H0L4 KDM2B-206ENST00000538046 2301 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.985e-15■■■■■ 51.1
CSTF2TQ9H0L4 KDM2B-208ENST00000538379 574 ntTSL 47.61□□□□□ -1.195e-15■■■■■ 51.1
CSTF2TQ9H0L4 KDM2B-218ENST00000545022 544 ntTSL 46.13□□□□□ -1.435e-15■■■■■ 51.1
CSTF2TQ9H0L4 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.391e-15■■■■■ 50.9
CSTF2TQ9H0L4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 50.8
CSTF2TQ9H0L4 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-15■■■■■ 50
CSTF2TQ9H0L4 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.392e-15■■■■■ 50
CSTF2TQ9H0L4 IMMT-207ENST00000449247 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.672e-15■■■■■ 50
CSTF2TQ9H0L4 IMMT-202ENST00000409051 2515 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.712e-15■■■■■ 50
CSTF2TQ9H0L4 IMMT-206ENST00000442664 2627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.842e-15■■■■■ 50
CSTF2TQ9H0L4 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.22e-15■■■■■ 50
CSTF2TQ9H0L4 IMMT-205ENST00000419070 2172 ntTSL 57.26□□□□□ -1.252e-15■■■■■ 50
CSTF2TQ9H0L4 RPL38-201ENST00000311111 1170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.876e-9■■■■■ 48.8
CSTF2TQ9H0L4 EHMT1-224ENST00000630754 709 ntTSL 318.17■□□□□ 0.52e-14■■■■■ 48.7
CSTF2TQ9H0L4 EHMT1-202ENST00000460486 818 ntTSL 515.94■□□□□ 0.142e-14■■■■■ 48.7
CSTF2TQ9H0L4 EHMT1-219ENST00000626066 1297 ntTSL 515.83■□□□□ 0.122e-14■■■■■ 48.7
CSTF2TQ9H0L4 EHMT1-250ENST00000637977 2167 ntTSL 514.4□□□□□ -0.12e-14■■■■■ 48.7
CSTF2TQ9H0L4 EHMT1-220ENST00000626216 558 ntTSL 313.06□□□□□ -0.322e-14■■■■■ 48.7
CSTF2TQ9H0L4 EHMT1-222ENST00000629417 882 ntTSL 310.56□□□□□ -0.722e-14■■■■■ 48.7
CSTF2TQ9H0L4 EHMT1-215ENST00000492232 710 ntTSL 310.55□□□□□ -0.722e-14■■■■■ 48.7
CSTF2TQ9H0L4 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.752e-14■■■■■ 48.7
CSTF2TQ9H0L4 ATXN7L1-202ENST00000419735 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -17e-14■■■■■ 48.5
CSTF2TQ9H0L4 PABPC1L-216ENST00000490798 1384 ntTSL 317.93■□□□□ 0.462e-16■■■■■ 47.8
CSTF2TQ9H0L4 PABPC1L-205ENST00000372819 2100 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.652e-16■■■■■ 47.8
CSTF2TQ9H0L4 PABPC1L-208ENST00000372826 854 ntTSL 59.52□□□□□ -0.892e-16■■■■■ 47.8
CSTF2TQ9H0L4 F7-204ENST00000473085 558 ntTSL 417.13■□□□□ 0.336e-7■■■■■ 47.6
CSTF2TQ9H0L4 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.519e-12■■■■■ 47.6
CSTF2TQ9H0L4 PHKB-202ENST00000323584 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.779e-12■■■■■ 47.6
CSTF2TQ9H0L4 PHKB-217ENST00000570047 797 ntTSL 39.65□□□□□ -0.869e-12■■■■■ 47.6
CSTF2TQ9H0L4 PHKB-214ENST00000567402 1617 ntTSL 1 (best)9.33□□□□□ -0.929e-12■■■■■ 47.6
CSTF2TQ9H0L4 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.259e-12■■■■■ 47.6
CSTF2TQ9H0L4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.124e-11■■■■■ 46.5
CSTF2TQ9H0L4 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.484e-11■■■■■ 46.5
CSTF2TQ9H0L4 ABCA11P-203ENST00000507854 1503 ntTSL 1 (best)9.5□□□□□ -0.893e-25■■■■■ 46.4
CSTF2TQ9H0L4 ABCA11P-201ENST00000451020 1815 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.063e-25■■■■■ 46.4
CSTF2TQ9H0L4 ZNF721-206ENST00000515578 1679 ntTSL 1 (best)8.25□□□□□ -1.093e-25■■■■■ 46.4
CSTF2TQ9H0L4 ABCA11P-204ENST00000514396 1423 ntTSL 1 (best)7.12□□□□□ -1.273e-25■■■■■ 46.4
CSTF2TQ9H0L4 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.333e-25■■■■■ 46.4
CSTF2TQ9H0L4 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.513e-25■■■■■ 46.4
CSTF2TQ9H0L4 ZNF721-204ENST00000507078 355 ntTSL 53.42□□□□□ -1.863e-25■■■■■ 46.4
CSTF2TQ9H0L4 OAZ1-203ENST00000586054 2832 nt20.88■□□□□ 0.934e-17■■■■■ 46.2
CSTF2TQ9H0L4 JDP2-206ENST00000559060 631 ntTSL 324.26■■□□□ 1.474e-14■■■■■ 46
CSTF2TQ9H0L4 JDP2-205ENST00000558068 454 ntTSL 324.26■■□□□ 1.474e-14■■■■■ 46
CSTF2TQ9H0L4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.714e-14■■■■■ 46
CSTF2TQ9H0L4 JDP2-207ENST00000559773 558 ntTSL 216.63■□□□□ 0.254e-14■■■■■ 46
CSTF2TQ9H0L4 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.494e-14■■■■■ 46
CSTF2TQ9H0L4 JDP2-204ENST00000437176 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.934e-14■■■■■ 46
CSTF2TQ9H0L4 TMEM91-201ENST00000342187 454 ntTSL 59.6□□□□□ -0.873e-7■■■■■ 45.8
CSTF2TQ9H0L4 MRPS6-202ENST00000477091 1061 ntTSL 516.46■□□□□ 0.231e-19■■■■■ 45.8
CSTF2TQ9H0L4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.021e-19■■■■■ 45.8
CSTF2TQ9H0L4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.091e-19■■■■■ 45.8
CSTF2TQ9H0L4 MRPS6-205ENST00000488492 909 ntTSL 57.45□□□□□ -1.221e-19■■■■■ 45.8
CSTF2TQ9H0L4 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.861e-19■■■■■ 45.8
CSTF2TQ9H0L4 GAK-208ENST00000507124 552 ntTSL 422.38■■□□□ 1.178e-14■■■■■ 45.8
CSTF2TQ9H0L4 OAZ1-209ENST00000592787 857 ntTSL 215.27■□□□□ 0.044e-28■■■■■ 45.8
CSTF2TQ9H0L4 PMM2-214ENST00000567697 5409 ntTSL 1 (best)11.65□□□□□ -0.559e-15■■■■■ 45.8
CSTF2TQ9H0L4 SRSF1-203ENST00000581497 438 ntTSL 37.38□□□□□ -1.231e-323■■■■■ 45.1
CSTF2TQ9H0L4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.442e-10■■■■■ 45
CSTF2TQ9H0L4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.372e-10■■■■■ 45
CSTF2TQ9H0L4 KRTCAP3-204ENST00000453171 665 ntTSL 311.02□□□□□ -0.652e-10■■■■■ 45
CSTF2TQ9H0L4 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.413e-12■■■■■ 44.8
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.721e-9■■■■■ 44.8
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP5-208ENST00000555814 583 ntTSL 48.13□□□□□ -1.111e-9■■■■■ 44.8
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.551e-9■■■■■ 44.8
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.641e-9■■■■■ 44.8
CSTF2TQ9H0L4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.014e-13■■■■■ 44.6
CSTF2TQ9H0L4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.014e-13■■■■■ 44.6
CSTF2TQ9H0L4 TFPT-204ENST00000420715 737 ntTSL 521.37■■□□□ 1.014e-13■■■■■ 44.6
CSTF2TQ9H0L4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.174e-13■■■■■ 44.6
CSTF2TQ9H0L4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.853e-11■■■■■ 44.4
CSTF2TQ9H0L4 SIRT7-202ENST00000536038 1883 ntTSL 220.05■□□□□ 0.83e-11■■■■■ 44.4
CSTF2TQ9H0L4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.021e-11■■■■■ 44.3
CSTF2TQ9H0L4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.061e-11■■■■■ 44.3
CSTF2TQ9H0L4 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.371e-11■■■■■ 44.3
CSTF2TQ9H0L4 AFAP1-202ENST00000360265 7479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.811e-11■■■■■ 44.3
CSTF2TQ9H0L4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.442e-17■■■■■ 44.2
CSTF2TQ9H0L4 OAZ1-210ENST00000593012 1357 ntTSL 216.26■□□□□ 0.192e-17■■■■■ 44.2
CSTF2TQ9H0L4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.142e-17■■■■■ 44.2
CSTF2TQ9H0L4 OAZ1-201ENST00000581150 1131 ntTSL 515.69■□□□□ 0.12e-17■■■■■ 44.2
CSTF2TQ9H0L4 OAZ1-207ENST00000590943 1012 ntTSL 214.96□□□□□ -0.012e-17■■■■■ 44.2
CSTF2TQ9H0L4 NPIPA1-203ENST00000472413 5345 ntTSL 215.33■□□□□ 0.043e-12■■■■■ 43.9
CSTF2TQ9H0L4 NPIPA1-206ENST00000541836 2747 ntTSL 513.09□□□□□ -0.313e-12■■■■■ 43.9
CSTF2TQ9H0L4 POLR2H-207ENST00000455712 823 ntTSL 311.8□□□□□ -0.521e-10■■■■■ 43.8
CSTF2TQ9H0L4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.218e-7■■■■■ 43.5
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