Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXD1Q9GZZ0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD1Q9GZZ0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD1Q9GZZ0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD1Q9GZZ0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD1Q9GZZ0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD1Q9GZZ0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD1Q9GZZ0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD1Q9GZZ0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD1Q9GZZ0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD1Q9GZZ0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD1Q9GZZ0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD1Q9GZZ0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD1Q9GZZ0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD1Q9GZZ0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD1Q9GZZ0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD1Q9GZZ0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD1Q9GZZ0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD1Q9GZZ0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD1Q9GZZ0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXD1Q9GZZ0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD1Q9GZZ0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD1Q9GZZ0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD1Q9GZZ0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD1Q9GZZ0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD1Q9GZZ0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD1Q9GZZ0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXD1Q9GZZ0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD1Q9GZZ0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD1Q9GZZ0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD1Q9GZZ0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD1Q9GZZ0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD1Q9GZZ0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD1Q9GZZ0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD1Q9GZZ0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD1Q9GZZ0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD1Q9GZZ0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD1Q9GZZ0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD1Q9GZZ0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD1Q9GZZ0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD1Q9GZZ0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD1Q9GZZ0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD1Q9GZZ0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD1Q9GZZ0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD1Q9GZZ0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD1Q9GZZ0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD1Q9GZZ0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD1Q9GZZ0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD1Q9GZZ0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD1Q9GZZ0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXD1Q9GZZ0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXD1Q9GZZ0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD1Q9GZZ0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD1Q9GZZ0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD1Q9GZZ0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD1Q9GZZ0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD1Q9GZZ0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD1Q9GZZ0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD1Q9GZZ0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD1Q9GZZ0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD1Q9GZZ0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD1Q9GZZ0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD1Q9GZZ0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD1Q9GZZ0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD1Q9GZZ0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD1Q9GZZ0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD1Q9GZZ0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD1Q9GZZ0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD1Q9GZZ0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD1Q9GZZ0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD1Q9GZZ0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD1Q9GZZ0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD1Q9GZZ0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD1Q9GZZ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD1Q9GZZ0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD1Q9GZZ0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD1Q9GZZ0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD1Q9GZZ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD1Q9GZZ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD1Q9GZZ0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD1Q9GZZ0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD1Q9GZZ0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD1Q9GZZ0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD1Q9GZZ0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD1Q9GZZ0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD1Q9GZZ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD1Q9GZZ0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD1Q9GZZ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD1Q9GZZ0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD1Q9GZZ0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD1Q9GZZ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD1Q9GZZ0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD1Q9GZZ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD1Q9GZZ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD1Q9GZZ0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD1Q9GZZ0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD1Q9GZZ0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD1Q9GZZ0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms