Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 50.8
FTOQ9C0B1 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 50.8
FTOQ9C0B1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.81e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 MICALL2-208ENST00000472100 5248 ntTSL 219.96■□□□□ 0.791e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.71e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.491e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.231e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.161e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 MICALL2-202ENST00000413446 3046 ntTSL 215.95■□□□□ 0.141e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.131e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.171e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.971e-10■■■■■ 49.6
FTOQ9C0B1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.059e-7■■■■■ 49.4
FTOQ9C0B1 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 421.48■■□□□ 1.039e-7■■■■■ 49.4
FTOQ9C0B1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.649e-7■■■■■ 49.4
FTOQ9C0B1 MAT1A-202ENST00000455001 435 ntTSL 512.15□□□□□ -0.465e-9■■■■■ 48.3
FTOQ9C0B1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.882e-7■■■■■ 47.9
FTOQ9C0B1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 47.9
FTOQ9C0B1 SERINC2-204ENST00000491976 2807 ntTSL 219.46■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 47.9
FTOQ9C0B1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 47.9
FTOQ9C0B1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 47.9
FTOQ9C0B1 ESRRA-206ENST00000539594 747 ntTSL 331.69■■■□□ 2.664e-10■■■■■ 47.3
FTOQ9C0B1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.574e-10■■■■■ 47.3
FTOQ9C0B1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.024e-10■■■■■ 47.3
FTOQ9C0B1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.751e-8■■■■■ 46.2
FTOQ9C0B1 FOXN3-204ENST00000553840 555 ntTSL 420.34■□□□□ 0.851e-11■■■■■ 45.9
FTOQ9C0B1 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.031e-11■■■■■ 45.9
FTOQ9C0B1 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.111e-11■■■■■ 45.9
FTOQ9C0B1 FOXN3-218ENST00000557718 398 ntTSL 56.8□□□□□ -1.321e-11■■■■■ 45.9
FTOQ9C0B1 FOXN3-206ENST00000554005 450 ntTSL 55.27□□□□□ -1.571e-11■■■■■ 45.9
FTOQ9C0B1 FOXN3-203ENST00000553353 366 ntTSL 34.06□□□□□ -1.761e-11■■■■■ 45.9
FTOQ9C0B1 FOXN3-213ENST00000556916 467 ntTSL 34.05□□□□□ -1.761e-11■■■■■ 45.9
FTOQ9C0B1 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 415.82■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 45.8
FTOQ9C0B1 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 02e-6■■■■■ 45.8
FTOQ9C0B1 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 45.8
FTOQ9C0B1 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 45.8
FTOQ9C0B1 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 45.8
FTOQ9C0B1 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 25.84□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 45.8
FTOQ9C0B1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 45.7
FTOQ9C0B1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.668e-10■■■■■ 45.6
FTOQ9C0B1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.736e-7■■■■■ 45.2
FTOQ9C0B1 ANKRD11-210ENST00000566858 580 ntTSL 418.53■□□□□ 0.561e-9■■■■■ 44.9
FTOQ9C0B1 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 217.68■□□□□ 0.421e-9■■■■■ 44.9
FTOQ9C0B1 ANKRD11-212ENST00000567699 412 ntTSL 517.47■□□□□ 0.391e-9■■■■■ 44.9
FTOQ9C0B1 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 516.45■□□□□ 0.221e-9■■■■■ 44.9
FTOQ9C0B1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.221e-9■■■■■ 44.9
FTOQ9C0B1 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 415.64■□□□□ 0.091e-9■■■■■ 44.9
FTOQ9C0B1 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 315.41■□□□□ 0.061e-9■■■■■ 44.9
FTOQ9C0B1 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 514.71□□□□□ -0.051e-9■■■■■ 44.9
FTOQ9C0B1 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 413.4□□□□□ -0.261e-9■■■■■ 44.9
FTOQ9C0B1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.569e-8■■■■■ 44.8
FTOQ9C0B1 MINK1-209ENST00000574453 4941 ntTSL 1 (best)18.06■□□□□ 0.489e-8■■■■■ 44.8
FTOQ9C0B1 MINK1-207ENST00000572330 5299 ntTSL 517.42■□□□□ 0.389e-8■■■■■ 44.8
FTOQ9C0B1 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.339e-8■■■■■ 44.8
FTOQ9C0B1 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.19e-8■■■■■ 44.8
FTOQ9C0B1 MINK1-213ENST00000577021 675 ntTSL 511.67□□□□□ -0.549e-8■■■■■ 44.8
FTOQ9C0B1 RNASET2-209ENST00000499370 2164 ntTSL 212.86□□□□□ -0.357e-16■■■■■ 43.7
FTOQ9C0B1 RNASET2-208ENST00000496851 881 ntTSL 511.33□□□□□ -0.67e-16■■■■■ 43.7
FTOQ9C0B1 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.247e-9■■■■■ 43.7
FTOQ9C0B1 FAM98B-204ENST00000559431 305 ntTSL 512.39□□□□□ -0.437e-9■■■■■ 43.7
FTOQ9C0B1 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.517e-16■■■■■ 43.3
FTOQ9C0B1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.026e-8■■■■■ 43
FTOQ9C0B1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.896e-8■■■■■ 43
FTOQ9C0B1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.846e-8■■■■■ 43
FTOQ9C0B1 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)16.95■□□□□ 0.36e-8■■■■■ 43
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FTOQ9C0B1 STXBP2-219ENST00000600702 770 ntTSL 215.23■□□□□ 0.036e-8■■■■■ 43
FTOQ9C0B1 BAZ2A-210ENST00000549787 2773 ntTSL 1 (best)14.79□□□□□ -0.047e-11■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.457e-11■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.587e-11■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.77e-11■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-216ENST00000543025 2522 ntTSL 1 (best)19.43■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-214ENST00000542030 460 ntTSL 416.18■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-203ENST00000446152 1549 ntTSL 515.68■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-209ENST00000538503 6676 ntTSL 515.44■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-212ENST00000541318 600 ntTSL 411.3□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-206ENST00000538046 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-208ENST00000538379 574 ntTSL 49.53□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 KDM2B-218ENST00000545022 544 ntTSL 47.48□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-216ENST00000509158 555 ntTSL 223.34■■□□□ 1.333e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.693e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-223ENST00000512671 795 ntTSL 217.92■□□□□ 0.463e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.283e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.273e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.063e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-213ENST00000506956 566 ntTSL 414.55□□□□□ -0.083e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-224ENST00000513182 537 ntTSL 49.53□□□□□ -0.883e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.993e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-222ENST00000512351 609 ntTSL 48.39□□□□□ -1.073e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-225ENST00000514380 1519 ntTSL 27.41□□□□□ -1.223e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-218ENST00000510778 716 ntTSL 54.64□□□□□ -1.673e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-219ENST00000511401 577 ntTSL 53.7□□□□□ -1.823e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-230ENST00000515023 388 ntTSL 52.75□□□□□ -1.973e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 RBPJ-229ENST00000514807 340 ntTSL 32.69□□□□□ -1.983e-9■■■■■ 42.9
FTOQ9C0B1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.384e-9■■■■■ 42.5
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