Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
NSD3Q9BZ95 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
NSD3Q9BZ95 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
NSD3Q9BZ95 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
NSD3Q9BZ95 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
NSD3Q9BZ95 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
NSD3Q9BZ95 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
NSD3Q9BZ95 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
NSD3Q9BZ95 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
NSD3Q9BZ95 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
NSD3Q9BZ95 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
NSD3Q9BZ95 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
NSD3Q9BZ95 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
NSD3Q9BZ95 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
NSD3Q9BZ95 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
NSD3Q9BZ95 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
NSD3Q9BZ95 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
NSD3Q9BZ95 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
NSD3Q9BZ95 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
NSD3Q9BZ95 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
NSD3Q9BZ95 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
NSD3Q9BZ95 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
NSD3Q9BZ95 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
NSD3Q9BZ95 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
NSD3Q9BZ95 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
NSD3Q9BZ95 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NSD3Q9BZ95 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NSD3Q9BZ95 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
NSD3Q9BZ95 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
NSD3Q9BZ95 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
NSD3Q9BZ95 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
NSD3Q9BZ95 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
NSD3Q9BZ95 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NSD3Q9BZ95 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NSD3Q9BZ95 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NSD3Q9BZ95 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NSD3Q9BZ95 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NSD3Q9BZ95 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NSD3Q9BZ95 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
NSD3Q9BZ95 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NSD3Q9BZ95 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NSD3Q9BZ95 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NSD3Q9BZ95 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
NSD3Q9BZ95 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
NSD3Q9BZ95 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
NSD3Q9BZ95 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
NSD3Q9BZ95 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
NSD3Q9BZ95 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
NSD3Q9BZ95 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
NSD3Q9BZ95 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
NSD3Q9BZ95 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
NSD3Q9BZ95 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
NSD3Q9BZ95 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
NSD3Q9BZ95 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.92■■■■□ 3.82
NSD3Q9BZ95 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
NSD3Q9BZ95 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
NSD3Q9BZ95 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
NSD3Q9BZ95 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
NSD3Q9BZ95 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
NSD3Q9BZ95 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
NSD3Q9BZ95 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NSD3Q9BZ95 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NSD3Q9BZ95 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC38.83■■■■□ 3.81
NSD3Q9BZ95 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
NSD3Q9BZ95 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
NSD3Q9BZ95 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NSD3Q9BZ95 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NSD3Q9BZ95 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NSD3Q9BZ95 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
NSD3Q9BZ95 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
NSD3Q9BZ95 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
NSD3Q9BZ95 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NSD3Q9BZ95 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NSD3Q9BZ95 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
NSD3Q9BZ95 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NSD3Q9BZ95 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
NSD3Q9BZ95 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
NSD3Q9BZ95 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
NSD3Q9BZ95 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
NSD3Q9BZ95 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC38.58■■■■□ 3.77
NSD3Q9BZ95 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
NSD3Q9BZ95 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
NSD3Q9BZ95 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
NSD3Q9BZ95 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
NSD3Q9BZ95 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
NSD3Q9BZ95 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
NSD3Q9BZ95 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NSD3Q9BZ95 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NSD3Q9BZ95 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NSD3Q9BZ95 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NSD3Q9BZ95 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NSD3Q9BZ95 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NSD3Q9BZ95 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
NSD3Q9BZ95 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
NSD3Q9BZ95 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NSD3Q9BZ95 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NSD3Q9BZ95 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NSD3Q9BZ95 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NSD3Q9BZ95 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NSD3Q9BZ95 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms