Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP1LC3CQ9BXW4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP1LC3CQ9BXW4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP1LC3CQ9BXW4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAP1LC3CQ9BXW4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MAP1LC3CQ9BXW4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MAP1LC3CQ9BXW4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP1LC3CQ9BXW4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP1LC3CQ9BXW4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAP1LC3CQ9BXW4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MAP1LC3CQ9BXW4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MAP1LC3CQ9BXW4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MAP1LC3CQ9BXW4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MAP1LC3CQ9BXW4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MAP1LC3CQ9BXW4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MAP1LC3CQ9BXW4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MAP1LC3CQ9BXW4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MAP1LC3CQ9BXW4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MAP1LC3CQ9BXW4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MAP1LC3CQ9BXW4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MAP1LC3CQ9BXW4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MAP1LC3CQ9BXW4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP1LC3CQ9BXW4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP1LC3CQ9BXW4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP1LC3CQ9BXW4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MAP1LC3CQ9BXW4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MAP1LC3CQ9BXW4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MAP1LC3CQ9BXW4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MAP1LC3CQ9BXW4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MAP1LC3CQ9BXW4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MAP1LC3CQ9BXW4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MAP1LC3CQ9BXW4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MAP1LC3CQ9BXW4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MAP1LC3CQ9BXW4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MAP1LC3CQ9BXW4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MAP1LC3CQ9BXW4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP1LC3CQ9BXW4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MAP1LC3CQ9BXW4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MAP1LC3CQ9BXW4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MAP1LC3CQ9BXW4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MAP1LC3CQ9BXW4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MAP1LC3CQ9BXW4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MAP1LC3CQ9BXW4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MAP1LC3CQ9BXW4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MAP1LC3CQ9BXW4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MAP1LC3CQ9BXW4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP1LC3CQ9BXW4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP1LC3CQ9BXW4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MAP1LC3CQ9BXW4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP1LC3CQ9BXW4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP1LC3CQ9BXW4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP1LC3CQ9BXW4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP1LC3CQ9BXW4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP1LC3CQ9BXW4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP1LC3CQ9BXW4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MAP1LC3CQ9BXW4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAP1LC3CQ9BXW4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP1LC3CQ9BXW4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP1LC3CQ9BXW4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MAP1LC3CQ9BXW4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MAP1LC3CQ9BXW4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MAP1LC3CQ9BXW4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MAP1LC3CQ9BXW4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAP1LC3CQ9BXW4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAP1LC3CQ9BXW4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAP1LC3CQ9BXW4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms