Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNHG12Q9BXW3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNHG12Q9BXW3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNHG12Q9BXW3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNHG12Q9BXW3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNHG12Q9BXW3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNHG12Q9BXW3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNHG12Q9BXW3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNHG12Q9BXW3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNHG12Q9BXW3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNHG12Q9BXW3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNHG12Q9BXW3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNHG12Q9BXW3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNHG12Q9BXW3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNHG12Q9BXW3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNHG12Q9BXW3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNHG12Q9BXW3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNHG12Q9BXW3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNHG12Q9BXW3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNHG12Q9BXW3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNHG12Q9BXW3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNHG12Q9BXW3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNHG12Q9BXW3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNHG12Q9BXW3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNHG12Q9BXW3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNHG12Q9BXW3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNHG12Q9BXW3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNHG12Q9BXW3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNHG12Q9BXW3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNHG12Q9BXW3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNHG12Q9BXW3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNHG12Q9BXW3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNHG12Q9BXW3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNHG12Q9BXW3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNHG12Q9BXW3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNHG12Q9BXW3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNHG12Q9BXW3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNHG12Q9BXW3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNHG12Q9BXW3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNHG12Q9BXW3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNHG12Q9BXW3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNHG12Q9BXW3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNHG12Q9BXW3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNHG12Q9BXW3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNHG12Q9BXW3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNHG12Q9BXW3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNHG12Q9BXW3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNHG12Q9BXW3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNHG12Q9BXW3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNHG12Q9BXW3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNHG12Q9BXW3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNHG12Q9BXW3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNHG12Q9BXW3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNHG12Q9BXW3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNHG12Q9BXW3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNHG12Q9BXW3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNHG12Q9BXW3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNHG12Q9BXW3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNHG12Q9BXW3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNHG12Q9BXW3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNHG12Q9BXW3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNHG12Q9BXW3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNHG12Q9BXW3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNHG12Q9BXW3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNHG12Q9BXW3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNHG12Q9BXW3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNHG12Q9BXW3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNHG12Q9BXW3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNHG12Q9BXW3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNHG12Q9BXW3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SNHG12Q9BXW3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNHG12Q9BXW3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNHG12Q9BXW3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SNHG12Q9BXW3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNHG12Q9BXW3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNHG12Q9BXW3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNHG12Q9BXW3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNHG12Q9BXW3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNHG12Q9BXW3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNHG12Q9BXW3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNHG12Q9BXW3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNHG12Q9BXW3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNHG12Q9BXW3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNHG12Q9BXW3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNHG12Q9BXW3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNHG12Q9BXW3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNHG12Q9BXW3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNHG12Q9BXW3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNHG12Q9BXW3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNHG12Q9BXW3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNHG12Q9BXW3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNHG12Q9BXW3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNHG12Q9BXW3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNHG12Q9BXW3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNHG12Q9BXW3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNHG12Q9BXW3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNHG12Q9BXW3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNHG12Q9BXW3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNHG12Q9BXW3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNHG12Q9BXW3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms