Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RPAP1Q9BWH6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RPAP1Q9BWH6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RPAP1Q9BWH6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
RPAP1Q9BWH6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RPAP1Q9BWH6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RPAP1Q9BWH6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RPAP1Q9BWH6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RPAP1Q9BWH6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RPAP1Q9BWH6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RPAP1Q9BWH6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RPAP1Q9BWH6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RPAP1Q9BWH6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RPAP1Q9BWH6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RPAP1Q9BWH6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RPAP1Q9BWH6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RPAP1Q9BWH6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RPAP1Q9BWH6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
RPAP1Q9BWH6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RPAP1Q9BWH6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RPAP1Q9BWH6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RPAP1Q9BWH6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RPAP1Q9BWH6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RPAP1Q9BWH6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RPAP1Q9BWH6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RPAP1Q9BWH6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RPAP1Q9BWH6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RPAP1Q9BWH6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RPAP1Q9BWH6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RPAP1Q9BWH6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RPAP1Q9BWH6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RPAP1Q9BWH6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RPAP1Q9BWH6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RPAP1Q9BWH6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RPAP1Q9BWH6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RPAP1Q9BWH6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RPAP1Q9BWH6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RPAP1Q9BWH6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RPAP1Q9BWH6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RPAP1Q9BWH6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RPAP1Q9BWH6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RPAP1Q9BWH6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RPAP1Q9BWH6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RPAP1Q9BWH6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RPAP1Q9BWH6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RPAP1Q9BWH6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
RPAP1Q9BWH6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RPAP1Q9BWH6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RPAP1Q9BWH6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RPAP1Q9BWH6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RPAP1Q9BWH6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RPAP1Q9BWH6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RPAP1Q9BWH6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RPAP1Q9BWH6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RPAP1Q9BWH6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RPAP1Q9BWH6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RPAP1Q9BWH6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RPAP1Q9BWH6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
RPAP1Q9BWH6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RPAP1Q9BWH6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RPAP1Q9BWH6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RPAP1Q9BWH6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RPAP1Q9BWH6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RPAP1Q9BWH6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RPAP1Q9BWH6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RPAP1Q9BWH6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RPAP1Q9BWH6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RPAP1Q9BWH6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RPAP1Q9BWH6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RPAP1Q9BWH6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RPAP1Q9BWH6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RPAP1Q9BWH6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RPAP1Q9BWH6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RPAP1Q9BWH6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RPAP1Q9BWH6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RPAP1Q9BWH6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RPAP1Q9BWH6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RPAP1Q9BWH6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RPAP1Q9BWH6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RPAP1Q9BWH6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RPAP1Q9BWH6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
RPAP1Q9BWH6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RPAP1Q9BWH6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RPAP1Q9BWH6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RPAP1Q9BWH6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RPAP1Q9BWH6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RPAP1Q9BWH6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RPAP1Q9BWH6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RPAP1Q9BWH6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RPAP1Q9BWH6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RPAP1Q9BWH6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RPAP1Q9BWH6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RPAP1Q9BWH6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RPAP1Q9BWH6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RPAP1Q9BWH6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RPAP1Q9BWH6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RPAP1Q9BWH6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RPAP1Q9BWH6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RPAP1Q9BWH6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RPAP1Q9BWH6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms