Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI9

NRIP2, Nuclear receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP2Q9BQI9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRIP2Q9BQI9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRIP2Q9BQI9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRIP2Q9BQI9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRIP2Q9BQI9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRIP2Q9BQI9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRIP2Q9BQI9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRIP2Q9BQI9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRIP2Q9BQI9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NRIP2Q9BQI9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRIP2Q9BQI9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRIP2Q9BQI9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRIP2Q9BQI9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NRIP2Q9BQI9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NRIP2Q9BQI9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRIP2Q9BQI9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRIP2Q9BQI9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRIP2Q9BQI9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRIP2Q9BQI9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRIP2Q9BQI9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRIP2Q9BQI9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRIP2Q9BQI9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRIP2Q9BQI9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRIP2Q9BQI9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRIP2Q9BQI9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRIP2Q9BQI9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NRIP2Q9BQI9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRIP2Q9BQI9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRIP2Q9BQI9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRIP2Q9BQI9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRIP2Q9BQI9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRIP2Q9BQI9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRIP2Q9BQI9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRIP2Q9BQI9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NRIP2Q9BQI9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRIP2Q9BQI9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRIP2Q9BQI9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRIP2Q9BQI9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRIP2Q9BQI9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRIP2Q9BQI9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP2Q9BQI9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP2Q9BQI9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRIP2Q9BQI9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRIP2Q9BQI9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRIP2Q9BQI9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRIP2Q9BQI9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRIP2Q9BQI9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRIP2Q9BQI9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRIP2Q9BQI9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRIP2Q9BQI9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP2Q9BQI9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP2Q9BQI9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP2Q9BQI9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP2Q9BQI9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP2Q9BQI9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP2Q9BQI9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRIP2Q9BQI9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRIP2Q9BQI9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP2Q9BQI9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP2Q9BQI9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP2Q9BQI9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP2Q9BQI9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP2Q9BQI9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP2Q9BQI9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP2Q9BQI9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRIP2Q9BQI9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRIP2Q9BQI9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP2Q9BQI9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP2Q9BQI9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP2Q9BQI9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP2Q9BQI9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP2Q9BQI9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP2Q9BQI9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRIP2Q9BQI9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRIP2Q9BQI9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP2Q9BQI9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP2Q9BQI9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP2Q9BQI9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP2Q9BQI9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRIP2Q9BQI9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRIP2Q9BQI9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRIP2Q9BQI9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRIP2Q9BQI9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRIP2Q9BQI9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRIP2Q9BQI9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRIP2Q9BQI9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRIP2Q9BQI9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRIP2Q9BQI9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRIP2Q9BQI9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRIP2Q9BQI9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NRIP2Q9BQI9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRIP2Q9BQI9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRIP2Q9BQI9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRIP2Q9BQI9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRIP2Q9BQI9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRIP2Q9BQI9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRIP2Q9BQI9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRIP2Q9BQI9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRIP2Q9BQI9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRIP2Q9BQI9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.6 ms