Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USB1Q9BQ65 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USB1Q9BQ65 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USB1Q9BQ65 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USB1Q9BQ65 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USB1Q9BQ65 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USB1Q9BQ65 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USB1Q9BQ65 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USB1Q9BQ65 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USB1Q9BQ65 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USB1Q9BQ65 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USB1Q9BQ65 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USB1Q9BQ65 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USB1Q9BQ65 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USB1Q9BQ65 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USB1Q9BQ65 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USB1Q9BQ65 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USB1Q9BQ65 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USB1Q9BQ65 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USB1Q9BQ65 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USB1Q9BQ65 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USB1Q9BQ65 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USB1Q9BQ65 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USB1Q9BQ65 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USB1Q9BQ65 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USB1Q9BQ65 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USB1Q9BQ65 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USB1Q9BQ65 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USB1Q9BQ65 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USB1Q9BQ65 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USB1Q9BQ65 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USB1Q9BQ65 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USB1Q9BQ65 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USB1Q9BQ65 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USB1Q9BQ65 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USB1Q9BQ65 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USB1Q9BQ65 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USB1Q9BQ65 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USB1Q9BQ65 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USB1Q9BQ65 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USB1Q9BQ65 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USB1Q9BQ65 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USB1Q9BQ65 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USB1Q9BQ65 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USB1Q9BQ65 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USB1Q9BQ65 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USB1Q9BQ65 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USB1Q9BQ65 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USB1Q9BQ65 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USB1Q9BQ65 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USB1Q9BQ65 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USB1Q9BQ65 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USB1Q9BQ65 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USB1Q9BQ65 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USB1Q9BQ65 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USB1Q9BQ65 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USB1Q9BQ65 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USB1Q9BQ65 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USB1Q9BQ65 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USB1Q9BQ65 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USB1Q9BQ65 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USB1Q9BQ65 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USB1Q9BQ65 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USB1Q9BQ65 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USB1Q9BQ65 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USB1Q9BQ65 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USB1Q9BQ65 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USB1Q9BQ65 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USB1Q9BQ65 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USB1Q9BQ65 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USB1Q9BQ65 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USB1Q9BQ65 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USB1Q9BQ65 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USB1Q9BQ65 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USB1Q9BQ65 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USB1Q9BQ65 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USB1Q9BQ65 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USB1Q9BQ65 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USB1Q9BQ65 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USB1Q9BQ65 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USB1Q9BQ65 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USB1Q9BQ65 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USB1Q9BQ65 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USB1Q9BQ65 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USB1Q9BQ65 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USB1Q9BQ65 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USB1Q9BQ65 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USB1Q9BQ65 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USB1Q9BQ65 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USB1Q9BQ65 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USB1Q9BQ65 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USB1Q9BQ65 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USB1Q9BQ65 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USB1Q9BQ65 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USB1Q9BQ65 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USB1Q9BQ65 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USB1Q9BQ65 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USB1Q9BQ65 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USB1Q9BQ65 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USB1Q9BQ65 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms