Protein–RNA interactions for Protein: Q99603

TRGV9, T-cell receptor gamma variable 9 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGV9Q99603 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRGV9Q99603 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRGV9Q99603 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRGV9Q99603 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRGV9Q99603 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRGV9Q99603 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRGV9Q99603 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRGV9Q99603 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRGV9Q99603 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRGV9Q99603 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRGV9Q99603 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRGV9Q99603 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRGV9Q99603 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRGV9Q99603 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRGV9Q99603 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRGV9Q99603 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRGV9Q99603 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRGV9Q99603 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRGV9Q99603 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRGV9Q99603 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRGV9Q99603 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRGV9Q99603 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRGV9Q99603 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRGV9Q99603 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRGV9Q99603 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRGV9Q99603 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRGV9Q99603 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRGV9Q99603 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRGV9Q99603 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRGV9Q99603 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRGV9Q99603 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRGV9Q99603 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRGV9Q99603 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRGV9Q99603 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRGV9Q99603 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRGV9Q99603 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRGV9Q99603 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRGV9Q99603 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRGV9Q99603 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRGV9Q99603 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRGV9Q99603 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRGV9Q99603 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRGV9Q99603 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRGV9Q99603 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRGV9Q99603 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRGV9Q99603 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRGV9Q99603 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRGV9Q99603 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRGV9Q99603 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRGV9Q99603 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRGV9Q99603 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRGV9Q99603 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRGV9Q99603 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRGV9Q99603 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRGV9Q99603 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRGV9Q99603 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRGV9Q99603 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRGV9Q99603 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRGV9Q99603 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRGV9Q99603 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRGV9Q99603 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRGV9Q99603 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRGV9Q99603 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRGV9Q99603 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRGV9Q99603 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRGV9Q99603 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRGV9Q99603 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRGV9Q99603 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRGV9Q99603 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRGV9Q99603 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRGV9Q99603 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRGV9Q99603 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRGV9Q99603 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRGV9Q99603 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRGV9Q99603 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRGV9Q99603 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRGV9Q99603 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRGV9Q99603 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRGV9Q99603 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRGV9Q99603 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRGV9Q99603 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRGV9Q99603 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRGV9Q99603 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRGV9Q99603 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRGV9Q99603 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRGV9Q99603 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRGV9Q99603 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRGV9Q99603 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRGV9Q99603 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRGV9Q99603 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRGV9Q99603 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRGV9Q99603 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRGV9Q99603 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRGV9Q99603 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRGV9Q99603 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRGV9Q99603 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRGV9Q99603 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRGV9Q99603 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRGV9Q99603 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRGV9Q99603 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms