Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKP4Q99569 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKP4Q99569 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKP4Q99569 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKP4Q99569 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKP4Q99569 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PKP4Q99569 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKP4Q99569 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKP4Q99569 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKP4Q99569 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKP4Q99569 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKP4Q99569 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKP4Q99569 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKP4Q99569 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKP4Q99569 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKP4Q99569 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKP4Q99569 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PKP4Q99569 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKP4Q99569 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKP4Q99569 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKP4Q99569 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKP4Q99569 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKP4Q99569 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKP4Q99569 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PKP4Q99569 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKP4Q99569 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKP4Q99569 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKP4Q99569 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PKP4Q99569 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKP4Q99569 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKP4Q99569 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKP4Q99569 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKP4Q99569 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PKP4Q99569 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PKP4Q99569 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKP4Q99569 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKP4Q99569 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKP4Q99569 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKP4Q99569 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKP4Q99569 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKP4Q99569 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKP4Q99569 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKP4Q99569 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKP4Q99569 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKP4Q99569 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKP4Q99569 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKP4Q99569 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKP4Q99569 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKP4Q99569 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKP4Q99569 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKP4Q99569 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PKP4Q99569 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKP4Q99569 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKP4Q99569 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKP4Q99569 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKP4Q99569 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PKP4Q99569 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKP4Q99569 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKP4Q99569 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PKP4Q99569 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKP4Q99569 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PKP4Q99569 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKP4Q99569 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKP4Q99569 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKP4Q99569 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKP4Q99569 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKP4Q99569 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKP4Q99569 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKP4Q99569 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PKP4Q99569 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PKP4Q99569 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PKP4Q99569 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKP4Q99569 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKP4Q99569 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKP4Q99569 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKP4Q99569 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKP4Q99569 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKP4Q99569 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKP4Q99569 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKP4Q99569 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKP4Q99569 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKP4Q99569 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKP4Q99569 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKP4Q99569 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKP4Q99569 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKP4Q99569 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKP4Q99569 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKP4Q99569 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKP4Q99569 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKP4Q99569 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKP4Q99569 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKP4Q99569 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKP4Q99569 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKP4Q99569 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKP4Q99569 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKP4Q99569 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PKP4Q99569 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKP4Q99569 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKP4Q99569 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKP4Q99569 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms