Protein–RNA interactions for Protein: Q99500

S1PR3, Sphingosine 1-phosphate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR3Q99500 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
S1PR3Q99500 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
S1PR3Q99500 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
S1PR3Q99500 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
S1PR3Q99500 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1PR3Q99500 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
S1PR3Q99500 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
S1PR3Q99500 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1PR3Q99500 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
S1PR3Q99500 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1PR3Q99500 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
S1PR3Q99500 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
S1PR3Q99500 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
S1PR3Q99500 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1PR3Q99500 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1PR3Q99500 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
S1PR3Q99500 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR3Q99500 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
S1PR3Q99500 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1PR3Q99500 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
S1PR3Q99500 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1PR3Q99500 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
S1PR3Q99500 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1PR3Q99500 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1PR3Q99500 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1PR3Q99500 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1PR3Q99500 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S1PR3Q99500 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR3Q99500 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR3Q99500 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1PR3Q99500 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1PR3Q99500 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1PR3Q99500 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR3Q99500 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1PR3Q99500 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1PR3Q99500 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1PR3Q99500 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1PR3Q99500 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1PR3Q99500 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1PR3Q99500 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1PR3Q99500 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1PR3Q99500 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR3Q99500 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR3Q99500 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
S1PR3Q99500 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
S1PR3Q99500 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
S1PR3Q99500 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
S1PR3Q99500 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
S1PR3Q99500 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
S1PR3Q99500 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
S1PR3Q99500 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
S1PR3Q99500 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1PR3Q99500 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
S1PR3Q99500 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
S1PR3Q99500 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1PR3Q99500 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1PR3Q99500 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1PR3Q99500 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
S1PR3Q99500 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1PR3Q99500 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR3Q99500 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR3Q99500 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR3Q99500 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR3Q99500 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR3Q99500 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
S1PR3Q99500 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
S1PR3Q99500 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
S1PR3Q99500 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
S1PR3Q99500 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
S1PR3Q99500 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
S1PR3Q99500 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
S1PR3Q99500 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
S1PR3Q99500 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
S1PR3Q99500 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
S1PR3Q99500 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
S1PR3Q99500 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
S1PR3Q99500 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
S1PR3Q99500 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
S1PR3Q99500 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
S1PR3Q99500 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
S1PR3Q99500 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
S1PR3Q99500 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
S1PR3Q99500 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
S1PR3Q99500 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
S1PR3Q99500 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
S1PR3Q99500 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
S1PR3Q99500 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
S1PR3Q99500 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
S1PR3Q99500 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
S1PR3Q99500 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
S1PR3Q99500 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
S1PR3Q99500 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
S1PR3Q99500 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
S1PR3Q99500 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
S1PR3Q99500 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
S1PR3Q99500 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
S1PR3Q99500 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
S1PR3Q99500 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
S1PR3Q99500 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
S1PR3Q99500 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms