Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX18Q96RF0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX18Q96RF0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX18Q96RF0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX18Q96RF0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX18Q96RF0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX18Q96RF0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX18Q96RF0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX18Q96RF0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX18Q96RF0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX18Q96RF0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX18Q96RF0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX18Q96RF0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX18Q96RF0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX18Q96RF0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX18Q96RF0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX18Q96RF0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX18Q96RF0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX18Q96RF0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX18Q96RF0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX18Q96RF0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX18Q96RF0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX18Q96RF0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX18Q96RF0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX18Q96RF0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX18Q96RF0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX18Q96RF0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX18Q96RF0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX18Q96RF0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX18Q96RF0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX18Q96RF0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX18Q96RF0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX18Q96RF0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX18Q96RF0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX18Q96RF0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX18Q96RF0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX18Q96RF0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX18Q96RF0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX18Q96RF0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX18Q96RF0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX18Q96RF0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX18Q96RF0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX18Q96RF0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX18Q96RF0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX18Q96RF0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX18Q96RF0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX18Q96RF0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX18Q96RF0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX18Q96RF0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX18Q96RF0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX18Q96RF0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX18Q96RF0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX18Q96RF0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX18Q96RF0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX18Q96RF0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX18Q96RF0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX18Q96RF0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX18Q96RF0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX18Q96RF0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX18Q96RF0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX18Q96RF0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX18Q96RF0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX18Q96RF0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX18Q96RF0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX18Q96RF0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX18Q96RF0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX18Q96RF0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX18Q96RF0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX18Q96RF0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX18Q96RF0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX18Q96RF0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX18Q96RF0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX18Q96RF0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX18Q96RF0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX18Q96RF0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX18Q96RF0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX18Q96RF0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX18Q96RF0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX18Q96RF0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX18Q96RF0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX18Q96RF0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX18Q96RF0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX18Q96RF0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX18Q96RF0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX18Q96RF0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX18Q96RF0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX18Q96RF0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX18Q96RF0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX18Q96RF0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX18Q96RF0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX18Q96RF0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX18Q96RF0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX18Q96RF0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX18Q96RF0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX18Q96RF0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX18Q96RF0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX18Q96RF0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX18Q96RF0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX18Q96RF0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX18Q96RF0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms