Protein–RNA interactions for Protein: Q96R05

RBP7, Retinoid-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP7Q96R05 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBP7Q96R05 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBP7Q96R05 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBP7Q96R05 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBP7Q96R05 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBP7Q96R05 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RBP7Q96R05 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBP7Q96R05 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBP7Q96R05 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBP7Q96R05 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBP7Q96R05 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBP7Q96R05 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBP7Q96R05 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBP7Q96R05 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBP7Q96R05 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBP7Q96R05 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBP7Q96R05 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBP7Q96R05 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBP7Q96R05 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBP7Q96R05 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBP7Q96R05 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBP7Q96R05 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBP7Q96R05 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBP7Q96R05 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBP7Q96R05 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBP7Q96R05 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBP7Q96R05 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBP7Q96R05 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP7Q96R05 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP7Q96R05 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP7Q96R05 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBP7Q96R05 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBP7Q96R05 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RBP7Q96R05 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBP7Q96R05 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBP7Q96R05 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBP7Q96R05 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RBP7Q96R05 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBP7Q96R05 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBP7Q96R05 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBP7Q96R05 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBP7Q96R05 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP7Q96R05 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP7Q96R05 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP7Q96R05 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBP7Q96R05 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP7Q96R05 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBP7Q96R05 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP7Q96R05 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP7Q96R05 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP7Q96R05 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP7Q96R05 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP7Q96R05 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP7Q96R05 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP7Q96R05 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBP7Q96R05 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBP7Q96R05 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBP7Q96R05 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBP7Q96R05 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBP7Q96R05 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBP7Q96R05 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBP7Q96R05 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBP7Q96R05 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBP7Q96R05 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBP7Q96R05 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBP7Q96R05 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBP7Q96R05 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBP7Q96R05 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBP7Q96R05 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBP7Q96R05 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBP7Q96R05 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBP7Q96R05 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBP7Q96R05 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBP7Q96R05 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBP7Q96R05 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBP7Q96R05 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBP7Q96R05 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBP7Q96R05 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBP7Q96R05 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBP7Q96R05 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBP7Q96R05 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP7Q96R05 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP7Q96R05 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP7Q96R05 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBP7Q96R05 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBP7Q96R05 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBP7Q96R05 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBP7Q96R05 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBP7Q96R05 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBP7Q96R05 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP7Q96R05 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP7Q96R05 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP7Q96R05 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP7Q96R05 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP7Q96R05 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP7Q96R05 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP7Q96R05 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP7Q96R05 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP7Q96R05 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP7Q96R05 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms