Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRMD6Q96NE9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMD6Q96NE9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMD6Q96NE9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMD6Q96NE9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMD6Q96NE9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMD6Q96NE9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMD6Q96NE9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMD6Q96NE9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMD6Q96NE9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMD6Q96NE9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMD6Q96NE9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMD6Q96NE9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMD6Q96NE9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMD6Q96NE9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMD6Q96NE9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMD6Q96NE9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMD6Q96NE9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMD6Q96NE9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMD6Q96NE9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMD6Q96NE9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMD6Q96NE9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMD6Q96NE9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMD6Q96NE9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMD6Q96NE9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
FRMD6Q96NE9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMD6Q96NE9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMD6Q96NE9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMD6Q96NE9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMD6Q96NE9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMD6Q96NE9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMD6Q96NE9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD6Q96NE9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD6Q96NE9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD6Q96NE9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMD6Q96NE9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMD6Q96NE9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMD6Q96NE9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD6Q96NE9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD6Q96NE9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD6Q96NE9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD6Q96NE9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FRMD6Q96NE9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMD6Q96NE9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMD6Q96NE9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FRMD6Q96NE9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMD6Q96NE9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FRMD6Q96NE9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMD6Q96NE9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMD6Q96NE9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMD6Q96NE9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD6Q96NE9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD6Q96NE9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD6Q96NE9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD6Q96NE9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMD6Q96NE9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMD6Q96NE9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMD6Q96NE9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMD6Q96NE9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMD6Q96NE9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMD6Q96NE9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMD6Q96NE9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMD6Q96NE9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMD6Q96NE9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMD6Q96NE9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMD6Q96NE9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMD6Q96NE9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMD6Q96NE9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMD6Q96NE9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMD6Q96NE9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMD6Q96NE9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMD6Q96NE9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMD6Q96NE9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMD6Q96NE9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMD6Q96NE9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMD6Q96NE9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FRMD6Q96NE9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD6Q96NE9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD6Q96NE9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD6Q96NE9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FRMD6Q96NE9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FRMD6Q96NE9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FRMD6Q96NE9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FRMD6Q96NE9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMD6Q96NE9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMD6Q96NE9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMD6Q96NE9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMD6Q96NE9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMD6Q96NE9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMD6Q96NE9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMD6Q96NE9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMD6Q96NE9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMD6Q96NE9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMD6Q96NE9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMD6Q96NE9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMD6Q96NE9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMD6Q96NE9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMD6Q96NE9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMD6Q96NE9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMD6Q96NE9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms