Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC138Q96M89 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC138Q96M89 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC138Q96M89 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC138Q96M89 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC138Q96M89 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC138Q96M89 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC138Q96M89 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC138Q96M89 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC138Q96M89 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC138Q96M89 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC138Q96M89 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC138Q96M89 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC138Q96M89 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC138Q96M89 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC138Q96M89 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC138Q96M89 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC138Q96M89 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC138Q96M89 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC138Q96M89 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC138Q96M89 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC138Q96M89 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC138Q96M89 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC138Q96M89 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC138Q96M89 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC138Q96M89 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC138Q96M89 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC138Q96M89 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC138Q96M89 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC138Q96M89 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC138Q96M89 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC138Q96M89 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC138Q96M89 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC138Q96M89 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC138Q96M89 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC138Q96M89 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC138Q96M89 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC138Q96M89 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC138Q96M89 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC138Q96M89 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC138Q96M89 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC138Q96M89 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC138Q96M89 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC138Q96M89 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC138Q96M89 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC138Q96M89 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC138Q96M89 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC138Q96M89 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC138Q96M89 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC138Q96M89 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC138Q96M89 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC138Q96M89 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC138Q96M89 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC138Q96M89 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC138Q96M89 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC138Q96M89 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC138Q96M89 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC138Q96M89 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC138Q96M89 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC138Q96M89 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC138Q96M89 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC138Q96M89 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC138Q96M89 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC138Q96M89 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC138Q96M89 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC138Q96M89 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC138Q96M89 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC138Q96M89 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC138Q96M89 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC138Q96M89 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC138Q96M89 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC138Q96M89 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC138Q96M89 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC138Q96M89 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC138Q96M89 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC138Q96M89 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC138Q96M89 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC138Q96M89 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC138Q96M89 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC138Q96M89 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC138Q96M89 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC138Q96M89 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC138Q96M89 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC138Q96M89 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC138Q96M89 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC138Q96M89 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC138Q96M89 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC138Q96M89 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC138Q96M89 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC138Q96M89 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC138Q96M89 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC138Q96M89 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC138Q96M89 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC138Q96M89 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC138Q96M89 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC138Q96M89 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC138Q96M89 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC138Q96M89 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC138Q96M89 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC138Q96M89 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms