Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKNOX2Q96KN3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PKNOX2Q96KN3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PKNOX2Q96KN3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKNOX2Q96KN3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKNOX2Q96KN3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PKNOX2Q96KN3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PKNOX2Q96KN3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PKNOX2Q96KN3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PKNOX2Q96KN3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PKNOX2Q96KN3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PKNOX2Q96KN3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PKNOX2Q96KN3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PKNOX2Q96KN3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PKNOX2Q96KN3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PKNOX2Q96KN3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKNOX2Q96KN3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKNOX2Q96KN3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PKNOX2Q96KN3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKNOX2Q96KN3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKNOX2Q96KN3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKNOX2Q96KN3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKNOX2Q96KN3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKNOX2Q96KN3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PKNOX2Q96KN3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PKNOX2Q96KN3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PKNOX2Q96KN3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PKNOX2Q96KN3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PKNOX2Q96KN3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKNOX2Q96KN3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKNOX2Q96KN3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PKNOX2Q96KN3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PKNOX2Q96KN3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PKNOX2Q96KN3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PKNOX2Q96KN3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PKNOX2Q96KN3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKNOX2Q96KN3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKNOX2Q96KN3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKNOX2Q96KN3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKNOX2Q96KN3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKNOX2Q96KN3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PKNOX2Q96KN3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PKNOX2Q96KN3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PKNOX2Q96KN3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PKNOX2Q96KN3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PKNOX2Q96KN3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PKNOX2Q96KN3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PKNOX2Q96KN3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PKNOX2Q96KN3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PKNOX2Q96KN3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PKNOX2Q96KN3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PKNOX2Q96KN3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKNOX2Q96KN3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKNOX2Q96KN3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PKNOX2Q96KN3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PKNOX2Q96KN3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PKNOX2Q96KN3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PKNOX2Q96KN3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PKNOX2Q96KN3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PKNOX2Q96KN3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PKNOX2Q96KN3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PKNOX2Q96KN3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PKNOX2Q96KN3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PKNOX2Q96KN3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PKNOX2Q96KN3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PKNOX2Q96KN3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PKNOX2Q96KN3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKNOX2Q96KN3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKNOX2Q96KN3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKNOX2Q96KN3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PKNOX2Q96KN3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKNOX2Q96KN3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PKNOX2Q96KN3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKNOX2Q96KN3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PKNOX2Q96KN3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKNOX2Q96KN3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PKNOX2Q96KN3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PKNOX2Q96KN3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKNOX2Q96KN3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKNOX2Q96KN3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PKNOX2Q96KN3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKNOX2Q96KN3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKNOX2Q96KN3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PKNOX2Q96KN3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PKNOX2Q96KN3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PKNOX2Q96KN3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKNOX2Q96KN3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKNOX2Q96KN3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKNOX2Q96KN3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKNOX2Q96KN3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKNOX2Q96KN3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKNOX2Q96KN3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKNOX2Q96KN3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKNOX2Q96KN3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKNOX2Q96KN3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKNOX2Q96KN3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKNOX2Q96KN3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKNOX2Q96KN3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKNOX2Q96KN3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKNOX2Q96KN3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms