Protein–RNA interactions for Protein: Q96HR9

REEP6, Receptor expression-enhancing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP6Q96HR9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP6Q96HR9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
REEP6Q96HR9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
REEP6Q96HR9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
REEP6Q96HR9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
REEP6Q96HR9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
REEP6Q96HR9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP6Q96HR9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
REEP6Q96HR9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
REEP6Q96HR9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP6Q96HR9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP6Q96HR9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REEP6Q96HR9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
REEP6Q96HR9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REEP6Q96HR9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REEP6Q96HR9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REEP6Q96HR9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REEP6Q96HR9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REEP6Q96HR9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REEP6Q96HR9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REEP6Q96HR9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REEP6Q96HR9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REEP6Q96HR9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
REEP6Q96HR9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
REEP6Q96HR9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
REEP6Q96HR9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
REEP6Q96HR9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
REEP6Q96HR9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
REEP6Q96HR9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
REEP6Q96HR9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
REEP6Q96HR9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
REEP6Q96HR9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
REEP6Q96HR9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
REEP6Q96HR9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
REEP6Q96HR9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
REEP6Q96HR9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
REEP6Q96HR9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REEP6Q96HR9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REEP6Q96HR9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REEP6Q96HR9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REEP6Q96HR9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REEP6Q96HR9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REEP6Q96HR9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REEP6Q96HR9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REEP6Q96HR9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REEP6Q96HR9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REEP6Q96HR9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REEP6Q96HR9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
REEP6Q96HR9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
REEP6Q96HR9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
REEP6Q96HR9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
REEP6Q96HR9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
REEP6Q96HR9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
REEP6Q96HR9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
REEP6Q96HR9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
REEP6Q96HR9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REEP6Q96HR9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REEP6Q96HR9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
REEP6Q96HR9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
REEP6Q96HR9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
REEP6Q96HR9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
REEP6Q96HR9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
REEP6Q96HR9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
REEP6Q96HR9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
REEP6Q96HR9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
REEP6Q96HR9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
REEP6Q96HR9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REEP6Q96HR9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
REEP6Q96HR9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
REEP6Q96HR9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REEP6Q96HR9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
REEP6Q96HR9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REEP6Q96HR9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REEP6Q96HR9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REEP6Q96HR9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
REEP6Q96HR9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
REEP6Q96HR9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REEP6Q96HR9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
REEP6Q96HR9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REEP6Q96HR9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REEP6Q96HR9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REEP6Q96HR9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REEP6Q96HR9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REEP6Q96HR9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REEP6Q96HR9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REEP6Q96HR9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REEP6Q96HR9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REEP6Q96HR9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REEP6Q96HR9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
REEP6Q96HR9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REEP6Q96HR9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REEP6Q96HR9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REEP6Q96HR9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REEP6Q96HR9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REEP6Q96HR9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
REEP6Q96HR9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
REEP6Q96HR9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REEP6Q96HR9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REEP6Q96HR9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REEP6Q96HR9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms