Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MALSU1Q96EH3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MALSU1Q96EH3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MALSU1Q96EH3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MALSU1Q96EH3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MALSU1Q96EH3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MALSU1Q96EH3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MALSU1Q96EH3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MALSU1Q96EH3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MALSU1Q96EH3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MALSU1Q96EH3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MALSU1Q96EH3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MALSU1Q96EH3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MALSU1Q96EH3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MALSU1Q96EH3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MALSU1Q96EH3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MALSU1Q96EH3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MALSU1Q96EH3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MALSU1Q96EH3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MALSU1Q96EH3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MALSU1Q96EH3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MALSU1Q96EH3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MALSU1Q96EH3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MALSU1Q96EH3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MALSU1Q96EH3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MALSU1Q96EH3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MALSU1Q96EH3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MALSU1Q96EH3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MALSU1Q96EH3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MALSU1Q96EH3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MALSU1Q96EH3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MALSU1Q96EH3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MALSU1Q96EH3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MALSU1Q96EH3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MALSU1Q96EH3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MALSU1Q96EH3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MALSU1Q96EH3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MALSU1Q96EH3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MALSU1Q96EH3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MALSU1Q96EH3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MALSU1Q96EH3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MALSU1Q96EH3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MALSU1Q96EH3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MALSU1Q96EH3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MALSU1Q96EH3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MALSU1Q96EH3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MALSU1Q96EH3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MALSU1Q96EH3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MALSU1Q96EH3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MALSU1Q96EH3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MALSU1Q96EH3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MALSU1Q96EH3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MALSU1Q96EH3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MALSU1Q96EH3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MALSU1Q96EH3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MALSU1Q96EH3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MALSU1Q96EH3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MALSU1Q96EH3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MALSU1Q96EH3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MALSU1Q96EH3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MALSU1Q96EH3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MALSU1Q96EH3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MALSU1Q96EH3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MALSU1Q96EH3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MALSU1Q96EH3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MALSU1Q96EH3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MALSU1Q96EH3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MALSU1Q96EH3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MALSU1Q96EH3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MALSU1Q96EH3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MALSU1Q96EH3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MALSU1Q96EH3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MALSU1Q96EH3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MALSU1Q96EH3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MALSU1Q96EH3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MALSU1Q96EH3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MALSU1Q96EH3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MALSU1Q96EH3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MALSU1Q96EH3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MALSU1Q96EH3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MALSU1Q96EH3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MALSU1Q96EH3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MALSU1Q96EH3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MALSU1Q96EH3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MALSU1Q96EH3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MALSU1Q96EH3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MALSU1Q96EH3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MALSU1Q96EH3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MALSU1Q96EH3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MALSU1Q96EH3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MALSU1Q96EH3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MALSU1Q96EH3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MALSU1Q96EH3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MALSU1Q96EH3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MALSU1Q96EH3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MALSU1Q96EH3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MALSU1Q96EH3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MALSU1Q96EH3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MALSU1Q96EH3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MALSU1Q96EH3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms