Protein–RNA interactions for Protein: Q96AP4

ZUFSP, Zinc finger with UFM1-specific peptidase domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZUFSPQ96AP4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZUFSPQ96AP4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZUFSPQ96AP4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZUFSPQ96AP4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZUFSPQ96AP4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZUFSPQ96AP4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZUFSPQ96AP4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZUFSPQ96AP4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZUFSPQ96AP4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZUFSPQ96AP4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZUFSPQ96AP4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZUFSPQ96AP4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZUFSPQ96AP4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZUFSPQ96AP4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZUFSPQ96AP4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZUFSPQ96AP4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZUFSPQ96AP4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZUFSPQ96AP4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZUFSPQ96AP4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZUFSPQ96AP4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZUFSPQ96AP4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZUFSPQ96AP4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZUFSPQ96AP4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZUFSPQ96AP4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ZUFSPQ96AP4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZUFSPQ96AP4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZUFSPQ96AP4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZUFSPQ96AP4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZUFSPQ96AP4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZUFSPQ96AP4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZUFSPQ96AP4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZUFSPQ96AP4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZUFSPQ96AP4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZUFSPQ96AP4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZUFSPQ96AP4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZUFSPQ96AP4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZUFSPQ96AP4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZUFSPQ96AP4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZUFSPQ96AP4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZUFSPQ96AP4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZUFSPQ96AP4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZUFSPQ96AP4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZUFSPQ96AP4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZUFSPQ96AP4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZUFSPQ96AP4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZUFSPQ96AP4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZUFSPQ96AP4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZUFSPQ96AP4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZUFSPQ96AP4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZUFSPQ96AP4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZUFSPQ96AP4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZUFSPQ96AP4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZUFSPQ96AP4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZUFSPQ96AP4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZUFSPQ96AP4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZUFSPQ96AP4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZUFSPQ96AP4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZUFSPQ96AP4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZUFSPQ96AP4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZUFSPQ96AP4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZUFSPQ96AP4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZUFSPQ96AP4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZUFSPQ96AP4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ZUFSPQ96AP4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZUFSPQ96AP4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZUFSPQ96AP4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZUFSPQ96AP4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZUFSPQ96AP4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZUFSPQ96AP4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZUFSPQ96AP4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZUFSPQ96AP4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ZUFSPQ96AP4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZUFSPQ96AP4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZUFSPQ96AP4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZUFSPQ96AP4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZUFSPQ96AP4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZUFSPQ96AP4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZUFSPQ96AP4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZUFSPQ96AP4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZUFSPQ96AP4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZUFSPQ96AP4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZUFSPQ96AP4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZUFSPQ96AP4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZUFSPQ96AP4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZUFSPQ96AP4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZUFSPQ96AP4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZUFSPQ96AP4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZUFSPQ96AP4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZUFSPQ96AP4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZUFSPQ96AP4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZUFSPQ96AP4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZUFSPQ96AP4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZUFSPQ96AP4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZUFSPQ96AP4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZUFSPQ96AP4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZUFSPQ96AP4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZUFSPQ96AP4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZUFSPQ96AP4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZUFSPQ96AP4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZUFSPQ96AP4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms