Protein–RNA interactions for Protein: Q96A09

FAM46B, Putative nucleotidyltransferase FAM46B, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46BQ96A09 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM46BQ96A09 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM46BQ96A09 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM46BQ96A09 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM46BQ96A09 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM46BQ96A09 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM46BQ96A09 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM46BQ96A09 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46BQ96A09 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46BQ96A09 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46BQ96A09 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM46BQ96A09 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM46BQ96A09 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM46BQ96A09 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM46BQ96A09 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM46BQ96A09 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM46BQ96A09 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM46BQ96A09 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM46BQ96A09 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM46BQ96A09 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM46BQ96A09 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM46BQ96A09 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM46BQ96A09 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM46BQ96A09 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM46BQ96A09 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM46BQ96A09 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM46BQ96A09 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM46BQ96A09 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM46BQ96A09 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM46BQ96A09 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM46BQ96A09 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM46BQ96A09 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM46BQ96A09 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM46BQ96A09 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM46BQ96A09 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM46BQ96A09 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM46BQ96A09 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM46BQ96A09 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM46BQ96A09 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM46BQ96A09 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM46BQ96A09 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM46BQ96A09 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM46BQ96A09 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM46BQ96A09 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM46BQ96A09 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM46BQ96A09 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM46BQ96A09 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM46BQ96A09 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM46BQ96A09 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM46BQ96A09 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM46BQ96A09 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM46BQ96A09 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM46BQ96A09 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM46BQ96A09 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM46BQ96A09 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM46BQ96A09 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM46BQ96A09 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM46BQ96A09 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM46BQ96A09 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46BQ96A09 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46BQ96A09 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46BQ96A09 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46BQ96A09 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM46BQ96A09 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM46BQ96A09 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM46BQ96A09 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM46BQ96A09 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM46BQ96A09 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM46BQ96A09 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM46BQ96A09 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM46BQ96A09 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM46BQ96A09 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM46BQ96A09 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM46BQ96A09 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM46BQ96A09 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM46BQ96A09 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM46BQ96A09 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM46BQ96A09 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM46BQ96A09 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM46BQ96A09 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM46BQ96A09 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM46BQ96A09 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM46BQ96A09 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM46BQ96A09 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM46BQ96A09 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM46BQ96A09 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM46BQ96A09 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46BQ96A09 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM46BQ96A09 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM46BQ96A09 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM46BQ96A09 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM46BQ96A09 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM46BQ96A09 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM46BQ96A09 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM46BQ96A09 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM46BQ96A09 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM46BQ96A09 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM46BQ96A09 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM46BQ96A09 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM46BQ96A09 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms