Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB1CQ92928 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB1CQ92928 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB1CQ92928 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB1CQ92928 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB1CQ92928 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB1CQ92928 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB1CQ92928 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB1CQ92928 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB1CQ92928 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB1CQ92928 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB1CQ92928 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB1CQ92928 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB1CQ92928 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB1CQ92928 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB1CQ92928 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB1CQ92928 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB1CQ92928 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB1CQ92928 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB1CQ92928 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB1CQ92928 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB1CQ92928 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB1CQ92928 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB1CQ92928 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB1CQ92928 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB1CQ92928 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB1CQ92928 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB1CQ92928 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB1CQ92928 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB1CQ92928 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB1CQ92928 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB1CQ92928 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB1CQ92928 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB1CQ92928 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB1CQ92928 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB1CQ92928 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB1CQ92928 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB1CQ92928 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB1CQ92928 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB1CQ92928 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB1CQ92928 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB1CQ92928 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB1CQ92928 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB1CQ92928 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB1CQ92928 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB1CQ92928 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB1CQ92928 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB1CQ92928 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB1CQ92928 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB1CQ92928 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB1CQ92928 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB1CQ92928 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB1CQ92928 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB1CQ92928 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB1CQ92928 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB1CQ92928 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB1CQ92928 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB1CQ92928 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB1CQ92928 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB1CQ92928 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB1CQ92928 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB1CQ92928 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB1CQ92928 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB1CQ92928 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB1CQ92928 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB1CQ92928 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB1CQ92928 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB1CQ92928 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB1CQ92928 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB1CQ92928 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB1CQ92928 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB1CQ92928 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB1CQ92928 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB1CQ92928 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB1CQ92928 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB1CQ92928 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB1CQ92928 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB1CQ92928 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB1CQ92928 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB1CQ92928 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB1CQ92928 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB1CQ92928 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB1CQ92928 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB1CQ92928 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB1CQ92928 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB1CQ92928 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB1CQ92928 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB1CQ92928 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB1CQ92928 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB1CQ92928 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB1CQ92928 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB1CQ92928 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB1CQ92928 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB1CQ92928 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB1CQ92928 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB1CQ92928 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB1CQ92928 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB1CQ92928 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB1CQ92928 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB1CQ92928 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms