Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP205Q92621 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP205Q92621 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUP205Q92621 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP205Q92621 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP205Q92621 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP205Q92621 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP205Q92621 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUP205Q92621 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUP205Q92621 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP205Q92621 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP205Q92621 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP205Q92621 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NUP205Q92621 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUP205Q92621 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP205Q92621 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP205Q92621 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP205Q92621 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP205Q92621 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP205Q92621 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP205Q92621 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP205Q92621 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP205Q92621 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP205Q92621 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP205Q92621 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP205Q92621 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP205Q92621 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP205Q92621 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP205Q92621 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP205Q92621 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUP205Q92621 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP205Q92621 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP205Q92621 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP205Q92621 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP205Q92621 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP205Q92621 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP205Q92621 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP205Q92621 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP205Q92621 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP205Q92621 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP205Q92621 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP205Q92621 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP205Q92621 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP205Q92621 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP205Q92621 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP205Q92621 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP205Q92621 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP205Q92621 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP205Q92621 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP205Q92621 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP205Q92621 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP205Q92621 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP205Q92621 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP205Q92621 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP205Q92621 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP205Q92621 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP205Q92621 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP205Q92621 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP205Q92621 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP205Q92621 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP205Q92621 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP205Q92621 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP205Q92621 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP205Q92621 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP205Q92621 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP205Q92621 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP205Q92621 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP205Q92621 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP205Q92621 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP205Q92621 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP205Q92621 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP205Q92621 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP205Q92621 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP205Q92621 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP205Q92621 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP205Q92621 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NUP205Q92621 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP205Q92621 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP205Q92621 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP205Q92621 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP205Q92621 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP205Q92621 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP205Q92621 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP205Q92621 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP205Q92621 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP205Q92621 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP205Q92621 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP205Q92621 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP205Q92621 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP205Q92621 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP205Q92621 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP205Q92621 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP205Q92621 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP205Q92621 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP205Q92621 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP205Q92621 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP205Q92621 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP205Q92621 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP205Q92621 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP205Q92621 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms