Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNIH3Q8TBE1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNIH3Q8TBE1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNIH3Q8TBE1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNIH3Q8TBE1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNIH3Q8TBE1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNIH3Q8TBE1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNIH3Q8TBE1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNIH3Q8TBE1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNIH3Q8TBE1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNIH3Q8TBE1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNIH3Q8TBE1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNIH3Q8TBE1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNIH3Q8TBE1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNIH3Q8TBE1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNIH3Q8TBE1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNIH3Q8TBE1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNIH3Q8TBE1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNIH3Q8TBE1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNIH3Q8TBE1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CNIH3Q8TBE1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNIH3Q8TBE1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNIH3Q8TBE1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNIH3Q8TBE1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNIH3Q8TBE1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNIH3Q8TBE1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNIH3Q8TBE1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNIH3Q8TBE1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNIH3Q8TBE1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNIH3Q8TBE1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNIH3Q8TBE1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNIH3Q8TBE1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNIH3Q8TBE1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNIH3Q8TBE1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNIH3Q8TBE1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNIH3Q8TBE1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNIH3Q8TBE1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNIH3Q8TBE1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNIH3Q8TBE1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNIH3Q8TBE1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNIH3Q8TBE1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNIH3Q8TBE1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNIH3Q8TBE1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNIH3Q8TBE1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNIH3Q8TBE1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNIH3Q8TBE1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNIH3Q8TBE1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNIH3Q8TBE1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNIH3Q8TBE1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNIH3Q8TBE1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNIH3Q8TBE1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNIH3Q8TBE1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNIH3Q8TBE1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNIH3Q8TBE1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNIH3Q8TBE1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNIH3Q8TBE1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNIH3Q8TBE1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNIH3Q8TBE1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNIH3Q8TBE1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNIH3Q8TBE1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNIH3Q8TBE1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNIH3Q8TBE1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNIH3Q8TBE1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNIH3Q8TBE1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNIH3Q8TBE1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNIH3Q8TBE1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNIH3Q8TBE1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNIH3Q8TBE1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNIH3Q8TBE1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNIH3Q8TBE1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNIH3Q8TBE1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNIH3Q8TBE1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNIH3Q8TBE1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNIH3Q8TBE1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNIH3Q8TBE1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNIH3Q8TBE1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNIH3Q8TBE1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNIH3Q8TBE1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNIH3Q8TBE1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNIH3Q8TBE1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNIH3Q8TBE1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNIH3Q8TBE1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNIH3Q8TBE1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNIH3Q8TBE1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNIH3Q8TBE1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNIH3Q8TBE1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNIH3Q8TBE1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNIH3Q8TBE1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNIH3Q8TBE1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNIH3Q8TBE1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNIH3Q8TBE1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNIH3Q8TBE1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNIH3Q8TBE1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNIH3Q8TBE1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CNIH3Q8TBE1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNIH3Q8TBE1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNIH3Q8TBE1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNIH3Q8TBE1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNIH3Q8TBE1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNIH3Q8TBE1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms