Protein–RNA interactions for Protein: Q8N841

TTLL6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL6Q8N841 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TTLL6Q8N841 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TTLL6Q8N841 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TTLL6Q8N841 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TTLL6Q8N841 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TTLL6Q8N841 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TTLL6Q8N841 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TTLL6Q8N841 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TTLL6Q8N841 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TTLL6Q8N841 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
TTLL6Q8N841 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TTLL6Q8N841 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TTLL6Q8N841 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TTLL6Q8N841 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TTLL6Q8N841 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TTLL6Q8N841 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TTLL6Q8N841 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TTLL6Q8N841 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TTLL6Q8N841 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TTLL6Q8N841 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TTLL6Q8N841 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
TTLL6Q8N841 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TTLL6Q8N841 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TTLL6Q8N841 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
TTLL6Q8N841 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TTLL6Q8N841 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TTLL6Q8N841 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TTLL6Q8N841 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TTLL6Q8N841 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
TTLL6Q8N841 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TTLL6Q8N841 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TTLL6Q8N841 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
TTLL6Q8N841 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
TTLL6Q8N841 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TTLL6Q8N841 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TTLL6Q8N841 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TTLL6Q8N841 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TTLL6Q8N841 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TTLL6Q8N841 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TTLL6Q8N841 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TTLL6Q8N841 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TTLL6Q8N841 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TTLL6Q8N841 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TTLL6Q8N841 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TTLL6Q8N841 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TTLL6Q8N841 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TTLL6Q8N841 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TTLL6Q8N841 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TTLL6Q8N841 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TTLL6Q8N841 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TTLL6Q8N841 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TTLL6Q8N841 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TTLL6Q8N841 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TTLL6Q8N841 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TTLL6Q8N841 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TTLL6Q8N841 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
TTLL6Q8N841 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TTLL6Q8N841 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TTLL6Q8N841 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TTLL6Q8N841 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TTLL6Q8N841 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TTLL6Q8N841 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TTLL6Q8N841 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TTLL6Q8N841 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TTLL6Q8N841 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TTLL6Q8N841 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
TTLL6Q8N841 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TTLL6Q8N841 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
TTLL6Q8N841 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TTLL6Q8N841 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TTLL6Q8N841 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TTLL6Q8N841 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TTLL6Q8N841 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TTLL6Q8N841 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TTLL6Q8N841 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TTLL6Q8N841 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TTLL6Q8N841 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
TTLL6Q8N841 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TTLL6Q8N841 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TTLL6Q8N841 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TTLL6Q8N841 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TTLL6Q8N841 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TTLL6Q8N841 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TTLL6Q8N841 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TTLL6Q8N841 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TTLL6Q8N841 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TTLL6Q8N841 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TTLL6Q8N841 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TTLL6Q8N841 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
TTLL6Q8N841 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TTLL6Q8N841 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
TTLL6Q8N841 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TTLL6Q8N841 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TTLL6Q8N841 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TTLL6Q8N841 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TTLL6Q8N841 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TTLL6Q8N841 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TTLL6Q8N841 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TTLL6Q8N841 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TTLL6Q8N841 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms