Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIP4Q8N3C7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIP4Q8N3C7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIP4Q8N3C7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP4Q8N3C7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP4Q8N3C7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CLIP4Q8N3C7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP4Q8N3C7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP4Q8N3C7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP4Q8N3C7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP4Q8N3C7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP4Q8N3C7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP4Q8N3C7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP4Q8N3C7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP4Q8N3C7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP4Q8N3C7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP4Q8N3C7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CLIP4Q8N3C7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP4Q8N3C7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP4Q8N3C7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP4Q8N3C7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP4Q8N3C7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP4Q8N3C7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP4Q8N3C7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP4Q8N3C7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP4Q8N3C7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP4Q8N3C7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP4Q8N3C7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP4Q8N3C7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP4Q8N3C7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP4Q8N3C7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP4Q8N3C7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP4Q8N3C7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP4Q8N3C7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP4Q8N3C7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP4Q8N3C7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLIP4Q8N3C7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLIP4Q8N3C7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIP4Q8N3C7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIP4Q8N3C7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIP4Q8N3C7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIP4Q8N3C7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIP4Q8N3C7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP4Q8N3C7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP4Q8N3C7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP4Q8N3C7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP4Q8N3C7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP4Q8N3C7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP4Q8N3C7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP4Q8N3C7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLIP4Q8N3C7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLIP4Q8N3C7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP4Q8N3C7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLIP4Q8N3C7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLIP4Q8N3C7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP4Q8N3C7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLIP4Q8N3C7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLIP4Q8N3C7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP4Q8N3C7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP4Q8N3C7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP4Q8N3C7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP4Q8N3C7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP4Q8N3C7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP4Q8N3C7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP4Q8N3C7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP4Q8N3C7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP4Q8N3C7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP4Q8N3C7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLIP4Q8N3C7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP4Q8N3C7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLIP4Q8N3C7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP4Q8N3C7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP4Q8N3C7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLIP4Q8N3C7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP4Q8N3C7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP4Q8N3C7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP4Q8N3C7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP4Q8N3C7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP4Q8N3C7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP4Q8N3C7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP4Q8N3C7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP4Q8N3C7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP4Q8N3C7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP4Q8N3C7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP4Q8N3C7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP4Q8N3C7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP4Q8N3C7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP4Q8N3C7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP4Q8N3C7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP4Q8N3C7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP4Q8N3C7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP4Q8N3C7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP4Q8N3C7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP4Q8N3C7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLIP4Q8N3C7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP4Q8N3C7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP4Q8N3C7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP4Q8N3C7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP4Q8N3C7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP4Q8N3C7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms