Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC13Q8IYE1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC13Q8IYE1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC13Q8IYE1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC13Q8IYE1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC13Q8IYE1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC13Q8IYE1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC13Q8IYE1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC13Q8IYE1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC13Q8IYE1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC13Q8IYE1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC13Q8IYE1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC13Q8IYE1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC13Q8IYE1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC13Q8IYE1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC13Q8IYE1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC13Q8IYE1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC13Q8IYE1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC13Q8IYE1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC13Q8IYE1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC13Q8IYE1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC13Q8IYE1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC13Q8IYE1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC13Q8IYE1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC13Q8IYE1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC13Q8IYE1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC13Q8IYE1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC13Q8IYE1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC13Q8IYE1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC13Q8IYE1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC13Q8IYE1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC13Q8IYE1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC13Q8IYE1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC13Q8IYE1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC13Q8IYE1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC13Q8IYE1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC13Q8IYE1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC13Q8IYE1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC13Q8IYE1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC13Q8IYE1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC13Q8IYE1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC13Q8IYE1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC13Q8IYE1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC13Q8IYE1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC13Q8IYE1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC13Q8IYE1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC13Q8IYE1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC13Q8IYE1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC13Q8IYE1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC13Q8IYE1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC13Q8IYE1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC13Q8IYE1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC13Q8IYE1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC13Q8IYE1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC13Q8IYE1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC13Q8IYE1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC13Q8IYE1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC13Q8IYE1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC13Q8IYE1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC13Q8IYE1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC13Q8IYE1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC13Q8IYE1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC13Q8IYE1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC13Q8IYE1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC13Q8IYE1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC13Q8IYE1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC13Q8IYE1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC13Q8IYE1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC13Q8IYE1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC13Q8IYE1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC13Q8IYE1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC13Q8IYE1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC13Q8IYE1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC13Q8IYE1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC13Q8IYE1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC13Q8IYE1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC13Q8IYE1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC13Q8IYE1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC13Q8IYE1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC13Q8IYE1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC13Q8IYE1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC13Q8IYE1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC13Q8IYE1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC13Q8IYE1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC13Q8IYE1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC13Q8IYE1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC13Q8IYE1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC13Q8IYE1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC13Q8IYE1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC13Q8IYE1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC13Q8IYE1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC13Q8IYE1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC13Q8IYE1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC13Q8IYE1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC13Q8IYE1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC13Q8IYE1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC13Q8IYE1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC13Q8IYE1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC13Q8IYE1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC13Q8IYE1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms