Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6K3

PTAR1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAR1Q7Z6K3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTAR1Q7Z6K3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTAR1Q7Z6K3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTAR1Q7Z6K3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTAR1Q7Z6K3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTAR1Q7Z6K3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTAR1Q7Z6K3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTAR1Q7Z6K3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTAR1Q7Z6K3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTAR1Q7Z6K3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTAR1Q7Z6K3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTAR1Q7Z6K3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTAR1Q7Z6K3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTAR1Q7Z6K3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTAR1Q7Z6K3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTAR1Q7Z6K3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTAR1Q7Z6K3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PTAR1Q7Z6K3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTAR1Q7Z6K3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTAR1Q7Z6K3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTAR1Q7Z6K3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PTAR1Q7Z6K3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTAR1Q7Z6K3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTAR1Q7Z6K3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTAR1Q7Z6K3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTAR1Q7Z6K3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTAR1Q7Z6K3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTAR1Q7Z6K3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTAR1Q7Z6K3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTAR1Q7Z6K3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTAR1Q7Z6K3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTAR1Q7Z6K3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTAR1Q7Z6K3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTAR1Q7Z6K3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTAR1Q7Z6K3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTAR1Q7Z6K3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTAR1Q7Z6K3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTAR1Q7Z6K3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTAR1Q7Z6K3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTAR1Q7Z6K3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTAR1Q7Z6K3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTAR1Q7Z6K3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PTAR1Q7Z6K3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTAR1Q7Z6K3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTAR1Q7Z6K3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTAR1Q7Z6K3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTAR1Q7Z6K3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTAR1Q7Z6K3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTAR1Q7Z6K3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTAR1Q7Z6K3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTAR1Q7Z6K3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTAR1Q7Z6K3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTAR1Q7Z6K3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTAR1Q7Z6K3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTAR1Q7Z6K3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTAR1Q7Z6K3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTAR1Q7Z6K3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTAR1Q7Z6K3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTAR1Q7Z6K3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTAR1Q7Z6K3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTAR1Q7Z6K3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTAR1Q7Z6K3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTAR1Q7Z6K3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTAR1Q7Z6K3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTAR1Q7Z6K3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTAR1Q7Z6K3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTAR1Q7Z6K3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTAR1Q7Z6K3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTAR1Q7Z6K3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTAR1Q7Z6K3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTAR1Q7Z6K3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTAR1Q7Z6K3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTAR1Q7Z6K3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTAR1Q7Z6K3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTAR1Q7Z6K3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTAR1Q7Z6K3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTAR1Q7Z6K3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTAR1Q7Z6K3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTAR1Q7Z6K3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTAR1Q7Z6K3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTAR1Q7Z6K3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTAR1Q7Z6K3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTAR1Q7Z6K3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTAR1Q7Z6K3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTAR1Q7Z6K3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTAR1Q7Z6K3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTAR1Q7Z6K3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTAR1Q7Z6K3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTAR1Q7Z6K3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTAR1Q7Z6K3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTAR1Q7Z6K3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTAR1Q7Z6K3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTAR1Q7Z6K3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTAR1Q7Z6K3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTAR1Q7Z6K3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTAR1Q7Z6K3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTAR1Q7Z6K3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTAR1Q7Z6K3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTAR1Q7Z6K3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTAR1Q7Z6K3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms