Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SCXQ7RTU7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCXQ7RTU7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCXQ7RTU7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCXQ7RTU7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCXQ7RTU7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCXQ7RTU7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCXQ7RTU7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCXQ7RTU7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCXQ7RTU7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCXQ7RTU7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCXQ7RTU7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCXQ7RTU7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCXQ7RTU7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCXQ7RTU7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCXQ7RTU7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCXQ7RTU7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCXQ7RTU7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCXQ7RTU7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCXQ7RTU7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCXQ7RTU7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCXQ7RTU7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCXQ7RTU7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCXQ7RTU7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCXQ7RTU7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCXQ7RTU7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCXQ7RTU7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCXQ7RTU7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCXQ7RTU7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCXQ7RTU7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCXQ7RTU7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCXQ7RTU7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCXQ7RTU7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCXQ7RTU7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCXQ7RTU7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCXQ7RTU7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCXQ7RTU7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCXQ7RTU7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCXQ7RTU7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCXQ7RTU7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCXQ7RTU7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCXQ7RTU7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCXQ7RTU7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCXQ7RTU7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCXQ7RTU7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCXQ7RTU7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCXQ7RTU7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCXQ7RTU7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCXQ7RTU7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCXQ7RTU7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCXQ7RTU7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCXQ7RTU7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCXQ7RTU7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCXQ7RTU7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCXQ7RTU7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCXQ7RTU7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCXQ7RTU7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCXQ7RTU7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCXQ7RTU7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCXQ7RTU7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCXQ7RTU7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCXQ7RTU7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCXQ7RTU7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCXQ7RTU7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCXQ7RTU7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCXQ7RTU7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCXQ7RTU7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCXQ7RTU7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCXQ7RTU7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCXQ7RTU7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCXQ7RTU7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCXQ7RTU7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCXQ7RTU7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCXQ7RTU7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCXQ7RTU7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCXQ7RTU7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCXQ7RTU7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCXQ7RTU7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCXQ7RTU7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCXQ7RTU7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCXQ7RTU7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCXQ7RTU7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms