Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP9Q7RTR0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP9Q7RTR0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP9Q7RTR0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP9Q7RTR0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP9Q7RTR0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP9Q7RTR0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP9Q7RTR0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP9Q7RTR0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP9Q7RTR0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP9Q7RTR0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP9Q7RTR0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP9Q7RTR0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP9Q7RTR0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP9Q7RTR0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP9Q7RTR0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP9Q7RTR0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP9Q7RTR0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP9Q7RTR0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP9Q7RTR0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP9Q7RTR0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP9Q7RTR0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP9Q7RTR0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP9Q7RTR0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP9Q7RTR0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP9Q7RTR0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP9Q7RTR0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP9Q7RTR0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP9Q7RTR0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP9Q7RTR0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP9Q7RTR0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP9Q7RTR0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP9Q7RTR0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP9Q7RTR0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP9Q7RTR0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP9Q7RTR0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP9Q7RTR0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP9Q7RTR0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP9Q7RTR0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NLRP9Q7RTR0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP9Q7RTR0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP9Q7RTR0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP9Q7RTR0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP9Q7RTR0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP9Q7RTR0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP9Q7RTR0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP9Q7RTR0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP9Q7RTR0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP9Q7RTR0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP9Q7RTR0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP9Q7RTR0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP9Q7RTR0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP9Q7RTR0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP9Q7RTR0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP9Q7RTR0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP9Q7RTR0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP9Q7RTR0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP9Q7RTR0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP9Q7RTR0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP9Q7RTR0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP9Q7RTR0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP9Q7RTR0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP9Q7RTR0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP9Q7RTR0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP9Q7RTR0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP9Q7RTR0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP9Q7RTR0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP9Q7RTR0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP9Q7RTR0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP9Q7RTR0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP9Q7RTR0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP9Q7RTR0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP9Q7RTR0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP9Q7RTR0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP9Q7RTR0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP9Q7RTR0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP9Q7RTR0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP9Q7RTR0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP9Q7RTR0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP9Q7RTR0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP9Q7RTR0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP9Q7RTR0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP9Q7RTR0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP9Q7RTR0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP9Q7RTR0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP9Q7RTR0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP9Q7RTR0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP9Q7RTR0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP9Q7RTR0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP9Q7RTR0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP9Q7RTR0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP9Q7RTR0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP9Q7RTR0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP9Q7RTR0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP9Q7RTR0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP9Q7RTR0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP9Q7RTR0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NLRP9Q7RTR0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NLRP9Q7RTR0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NLRP9Q7RTR0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms