Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FAM43BQ6ZT52 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FAM43BQ6ZT52 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
FAM43BQ6ZT52 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
FAM43BQ6ZT52 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
FAM43BQ6ZT52 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
FAM43BQ6ZT52 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FAM43BQ6ZT52 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FAM43BQ6ZT52 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FAM43BQ6ZT52 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FAM43BQ6ZT52 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FAM43BQ6ZT52 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FAM43BQ6ZT52 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FAM43BQ6ZT52 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FAM43BQ6ZT52 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FAM43BQ6ZT52 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FAM43BQ6ZT52 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FAM43BQ6ZT52 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FAM43BQ6ZT52 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FAM43BQ6ZT52 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
FAM43BQ6ZT52 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
FAM43BQ6ZT52 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
FAM43BQ6ZT52 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FAM43BQ6ZT52 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FAM43BQ6ZT52 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FAM43BQ6ZT52 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FAM43BQ6ZT52 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FAM43BQ6ZT52 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FAM43BQ6ZT52 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
FAM43BQ6ZT52 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
FAM43BQ6ZT52 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FAM43BQ6ZT52 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FAM43BQ6ZT52 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FAM43BQ6ZT52 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FAM43BQ6ZT52 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FAM43BQ6ZT52 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FAM43BQ6ZT52 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FAM43BQ6ZT52 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FAM43BQ6ZT52 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FAM43BQ6ZT52 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FAM43BQ6ZT52 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FAM43BQ6ZT52 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FAM43BQ6ZT52 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FAM43BQ6ZT52 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FAM43BQ6ZT52 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FAM43BQ6ZT52 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FAM43BQ6ZT52 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
FAM43BQ6ZT52 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
FAM43BQ6ZT52 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
FAM43BQ6ZT52 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
FAM43BQ6ZT52 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
FAM43BQ6ZT52 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FAM43BQ6ZT52 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
FAM43BQ6ZT52 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FAM43BQ6ZT52 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
FAM43BQ6ZT52 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FAM43BQ6ZT52 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
FAM43BQ6ZT52 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FAM43BQ6ZT52 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
FAM43BQ6ZT52 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FAM43BQ6ZT52 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FAM43BQ6ZT52 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FAM43BQ6ZT52 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FAM43BQ6ZT52 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FAM43BQ6ZT52 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FAM43BQ6ZT52 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FAM43BQ6ZT52 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FAM43BQ6ZT52 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FAM43BQ6ZT52 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FAM43BQ6ZT52 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
FAM43BQ6ZT52 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FAM43BQ6ZT52 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FAM43BQ6ZT52 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FAM43BQ6ZT52 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FAM43BQ6ZT52 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FAM43BQ6ZT52 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FAM43BQ6ZT52 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FAM43BQ6ZT52 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FAM43BQ6ZT52 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FAM43BQ6ZT52 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FAM43BQ6ZT52 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FAM43BQ6ZT52 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FAM43BQ6ZT52 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FAM43BQ6ZT52 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
FAM43BQ6ZT52 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FAM43BQ6ZT52 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FAM43BQ6ZT52 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FAM43BQ6ZT52 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
FAM43BQ6ZT52 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FAM43BQ6ZT52 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FAM43BQ6ZT52 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FAM43BQ6ZT52 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FAM43BQ6ZT52 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FAM43BQ6ZT52 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
FAM43BQ6ZT52 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
FAM43BQ6ZT52 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FAM43BQ6ZT52 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
FAM43BQ6ZT52 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FAM43BQ6ZT52 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
FAM43BQ6ZT52 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms