Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP12Q6UXS9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP12Q6UXS9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP12Q6UXS9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP12Q6UXS9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP12Q6UXS9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP12Q6UXS9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP12Q6UXS9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP12Q6UXS9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP12Q6UXS9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP12Q6UXS9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP12Q6UXS9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP12Q6UXS9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP12Q6UXS9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP12Q6UXS9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP12Q6UXS9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP12Q6UXS9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP12Q6UXS9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP12Q6UXS9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP12Q6UXS9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP12Q6UXS9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP12Q6UXS9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP12Q6UXS9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP12Q6UXS9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP12Q6UXS9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP12Q6UXS9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP12Q6UXS9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP12Q6UXS9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP12Q6UXS9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP12Q6UXS9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP12Q6UXS9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP12Q6UXS9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP12Q6UXS9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP12Q6UXS9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP12Q6UXS9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP12Q6UXS9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP12Q6UXS9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP12Q6UXS9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP12Q6UXS9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP12Q6UXS9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP12Q6UXS9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP12Q6UXS9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP12Q6UXS9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP12Q6UXS9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP12Q6UXS9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP12Q6UXS9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP12Q6UXS9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP12Q6UXS9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP12Q6UXS9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP12Q6UXS9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP12Q6UXS9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP12Q6UXS9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP12Q6UXS9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP12Q6UXS9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP12Q6UXS9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP12Q6UXS9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CASP12Q6UXS9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP12Q6UXS9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP12Q6UXS9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP12Q6UXS9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP12Q6UXS9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP12Q6UXS9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP12Q6UXS9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP12Q6UXS9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP12Q6UXS9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP12Q6UXS9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP12Q6UXS9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP12Q6UXS9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP12Q6UXS9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP12Q6UXS9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP12Q6UXS9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP12Q6UXS9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP12Q6UXS9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP12Q6UXS9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP12Q6UXS9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP12Q6UXS9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP12Q6UXS9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP12Q6UXS9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP12Q6UXS9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP12Q6UXS9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP12Q6UXS9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP12Q6UXS9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP12Q6UXS9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP12Q6UXS9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP12Q6UXS9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CASP12Q6UXS9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP12Q6UXS9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP12Q6UXS9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP12Q6UXS9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP12Q6UXS9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP12Q6UXS9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP12Q6UXS9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP12Q6UXS9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP12Q6UXS9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP12Q6UXS9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP12Q6UXS9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP12Q6UXS9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP12Q6UXS9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP12Q6UXS9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP12Q6UXS9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms