Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6Q795 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q6Q795 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q6Q795 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6Q795 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6Q795 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6Q795 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6Q795 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6Q795 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q6Q795 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6Q795 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6Q795 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6Q795 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q6Q795 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6Q795 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q6Q795 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6Q795 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6Q795 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6Q795 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6Q795 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6Q795 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6Q795 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6Q795 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6Q795 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6Q795 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6Q795 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6Q795 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6Q795 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6Q795 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6Q795 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6Q795 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6Q795 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6Q795 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6Q795 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6Q795 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6Q795 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6Q795 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6Q795 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6Q795 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6Q795 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6Q795 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6Q795 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6Q795 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6Q795 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6Q795 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6Q795 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q6Q795 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6Q795 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6Q795 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6Q795 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6Q795 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6Q795 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6Q795 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6Q795 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6Q795 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q6Q795 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6Q795 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6Q795 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6Q795 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6Q795 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q6Q795 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6Q795 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6Q795 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6Q795 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6Q795 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6Q795 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6Q795 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6Q795 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6Q795 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6Q795 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6Q795 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6Q795 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6Q795 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6Q795 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6Q795 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6Q795 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6Q795 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6Q795 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6Q795 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6Q795 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6Q795 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6Q795 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6Q795 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6Q795 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6Q795 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6Q795 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6Q795 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6Q795 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6Q795 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6Q795 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6Q795 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6Q795 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6Q795 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6Q795 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6Q795 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6Q795 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6Q795 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6Q795 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6Q795 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6Q795 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms