Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
LMOD2Q6P5Q4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
LMOD2Q6P5Q4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
LMOD2Q6P5Q4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
LMOD2Q6P5Q4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
LMOD2Q6P5Q4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
LMOD2Q6P5Q4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
LMOD2Q6P5Q4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
LMOD2Q6P5Q4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
LMOD2Q6P5Q4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
LMOD2Q6P5Q4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
LMOD2Q6P5Q4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
LMOD2Q6P5Q4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
LMOD2Q6P5Q4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
LMOD2Q6P5Q4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
LMOD2Q6P5Q4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
LMOD2Q6P5Q4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
LMOD2Q6P5Q4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
LMOD2Q6P5Q4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
LMOD2Q6P5Q4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
LMOD2Q6P5Q4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC40.05■■■■■ 4
LMOD2Q6P5Q4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
LMOD2Q6P5Q4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
LMOD2Q6P5Q4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
LMOD2Q6P5Q4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
LMOD2Q6P5Q4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.99
LMOD2Q6P5Q4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC39.93■■■■□ 3.98
LMOD2Q6P5Q4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
LMOD2Q6P5Q4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
LMOD2Q6P5Q4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
LMOD2Q6P5Q4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
LMOD2Q6P5Q4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
LMOD2Q6P5Q4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
LMOD2Q6P5Q4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
LMOD2Q6P5Q4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
LMOD2Q6P5Q4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
LMOD2Q6P5Q4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
LMOD2Q6P5Q4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
LMOD2Q6P5Q4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
LMOD2Q6P5Q4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
LMOD2Q6P5Q4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
LMOD2Q6P5Q4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
LMOD2Q6P5Q4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
LMOD2Q6P5Q4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
LMOD2Q6P5Q4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
LMOD2Q6P5Q4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
LMOD2Q6P5Q4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
LMOD2Q6P5Q4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
LMOD2Q6P5Q4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
LMOD2Q6P5Q4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
LMOD2Q6P5Q4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
LMOD2Q6P5Q4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
LMOD2Q6P5Q4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
LMOD2Q6P5Q4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
LMOD2Q6P5Q4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
LMOD2Q6P5Q4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
LMOD2Q6P5Q4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
LMOD2Q6P5Q4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
LMOD2Q6P5Q4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
LMOD2Q6P5Q4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
LMOD2Q6P5Q4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
LMOD2Q6P5Q4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
LMOD2Q6P5Q4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
LMOD2Q6P5Q4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
LMOD2Q6P5Q4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
LMOD2Q6P5Q4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
LMOD2Q6P5Q4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
LMOD2Q6P5Q4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
LMOD2Q6P5Q4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
LMOD2Q6P5Q4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
LMOD2Q6P5Q4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
LMOD2Q6P5Q4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
LMOD2Q6P5Q4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
LMOD2Q6P5Q4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
LMOD2Q6P5Q4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
LMOD2Q6P5Q4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
LMOD2Q6P5Q4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
LMOD2Q6P5Q4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
LMOD2Q6P5Q4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
LMOD2Q6P5Q4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
LMOD2Q6P5Q4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
LMOD2Q6P5Q4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
LMOD2Q6P5Q4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
LMOD2Q6P5Q4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
LMOD2Q6P5Q4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
LMOD2Q6P5Q4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
LMOD2Q6P5Q4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
LMOD2Q6P5Q4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
LMOD2Q6P5Q4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
LMOD2Q6P5Q4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
LMOD2Q6P5Q4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
LMOD2Q6P5Q4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
LMOD2Q6P5Q4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
LMOD2Q6P5Q4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
LMOD2Q6P5Q4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
LMOD2Q6P5Q4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
LMOD2Q6P5Q4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
LMOD2Q6P5Q4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms