Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC9A4Q6AI14 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC9A4Q6AI14 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC9A4Q6AI14 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC9A4Q6AI14 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC9A4Q6AI14 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC9A4Q6AI14 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC9A4Q6AI14 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC9A4Q6AI14 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC9A4Q6AI14 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC9A4Q6AI14 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC9A4Q6AI14 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC9A4Q6AI14 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC9A4Q6AI14 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC9A4Q6AI14 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC9A4Q6AI14 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC9A4Q6AI14 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC9A4Q6AI14 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC9A4Q6AI14 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC9A4Q6AI14 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC9A4Q6AI14 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC9A4Q6AI14 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC9A4Q6AI14 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC9A4Q6AI14 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC9A4Q6AI14 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC9A4Q6AI14 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC9A4Q6AI14 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC9A4Q6AI14 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC9A4Q6AI14 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC9A4Q6AI14 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC9A4Q6AI14 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC9A4Q6AI14 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC9A4Q6AI14 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC9A4Q6AI14 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC9A4Q6AI14 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC9A4Q6AI14 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC9A4Q6AI14 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC9A4Q6AI14 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC9A4Q6AI14 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC9A4Q6AI14 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC9A4Q6AI14 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC9A4Q6AI14 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC9A4Q6AI14 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC9A4Q6AI14 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC9A4Q6AI14 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC9A4Q6AI14 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC9A4Q6AI14 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC9A4Q6AI14 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC9A4Q6AI14 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC9A4Q6AI14 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLC9A4Q6AI14 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC9A4Q6AI14 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC9A4Q6AI14 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC9A4Q6AI14 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9A4Q6AI14 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9A4Q6AI14 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC9A4Q6AI14 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC9A4Q6AI14 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC9A4Q6AI14 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC9A4Q6AI14 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC9A4Q6AI14 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC9A4Q6AI14 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC9A4Q6AI14 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC9A4Q6AI14 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC9A4Q6AI14 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC9A4Q6AI14 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC9A4Q6AI14 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC9A4Q6AI14 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC9A4Q6AI14 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC9A4Q6AI14 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC9A4Q6AI14 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC9A4Q6AI14 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC9A4Q6AI14 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC9A4Q6AI14 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC9A4Q6AI14 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC9A4Q6AI14 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC9A4Q6AI14 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC9A4Q6AI14 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC9A4Q6AI14 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC9A4Q6AI14 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC9A4Q6AI14 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC9A4Q6AI14 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC9A4Q6AI14 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC9A4Q6AI14 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC9A4Q6AI14 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC9A4Q6AI14 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC9A4Q6AI14 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC9A4Q6AI14 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC9A4Q6AI14 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC9A4Q6AI14 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC9A4Q6AI14 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC9A4Q6AI14 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9A4Q6AI14 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9A4Q6AI14 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9A4Q6AI14 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC9A4Q6AI14 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC9A4Q6AI14 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC9A4Q6AI14 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC9A4Q6AI14 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC9A4Q6AI14 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms