Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
FOCADQ5VW36 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
FOCADQ5VW36 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FOCADQ5VW36 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
FOCADQ5VW36 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
FOCADQ5VW36 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
FOCADQ5VW36 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FOCADQ5VW36 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
FOCADQ5VW36 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
FOCADQ5VW36 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FOCADQ5VW36 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
FOCADQ5VW36 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
FOCADQ5VW36 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
FOCADQ5VW36 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FOCADQ5VW36 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
FOCADQ5VW36 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FOCADQ5VW36 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FOCADQ5VW36 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FOCADQ5VW36 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FOCADQ5VW36 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FOCADQ5VW36 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
FOCADQ5VW36 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
FOCADQ5VW36 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
FOCADQ5VW36 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
FOCADQ5VW36 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FOCADQ5VW36 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FOCADQ5VW36 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FOCADQ5VW36 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FOCADQ5VW36 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FOCADQ5VW36 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
FOCADQ5VW36 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FOCADQ5VW36 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FOCADQ5VW36 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FOCADQ5VW36 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FOCADQ5VW36 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FOCADQ5VW36 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FOCADQ5VW36 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FOCADQ5VW36 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FOCADQ5VW36 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FOCADQ5VW36 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FOCADQ5VW36 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FOCADQ5VW36 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FOCADQ5VW36 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
FOCADQ5VW36 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
FOCADQ5VW36 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
FOCADQ5VW36 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FOCADQ5VW36 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FOCADQ5VW36 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FOCADQ5VW36 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
FOCADQ5VW36 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
FOCADQ5VW36 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FOCADQ5VW36 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FOCADQ5VW36 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
FOCADQ5VW36 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
FOCADQ5VW36 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FOCADQ5VW36 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FOCADQ5VW36 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FOCADQ5VW36 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FOCADQ5VW36 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FOCADQ5VW36 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
FOCADQ5VW36 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
FOCADQ5VW36 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FOCADQ5VW36 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
FOCADQ5VW36 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
FOCADQ5VW36 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FOCADQ5VW36 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
FOCADQ5VW36 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
FOCADQ5VW36 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
FOCADQ5VW36 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FOCADQ5VW36 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
FOCADQ5VW36 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FOCADQ5VW36 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FOCADQ5VW36 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
FOCADQ5VW36 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FOCADQ5VW36 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FOCADQ5VW36 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FOCADQ5VW36 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FOCADQ5VW36 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FOCADQ5VW36 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
FOCADQ5VW36 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
FOCADQ5VW36 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FOCADQ5VW36 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FOCADQ5VW36 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FOCADQ5VW36 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FOCADQ5VW36 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FOCADQ5VW36 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FOCADQ5VW36 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FOCADQ5VW36 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FOCADQ5VW36 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FOCADQ5VW36 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FOCADQ5VW36 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
FOCADQ5VW36 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FOCADQ5VW36 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
FOCADQ5VW36 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
FOCADQ5VW36 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FOCADQ5VW36 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
FOCADQ5VW36 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
FOCADQ5VW36 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
FOCADQ5VW36 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FOCADQ5VW36 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms