Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAPPA-AS1Q5QFB9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAPPA-AS1Q5QFB9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAPPA-AS1Q5QFB9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAPPA-AS1Q5QFB9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPPA-AS1Q5QFB9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPPA-AS1Q5QFB9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAPPA-AS1Q5QFB9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPPA-AS1Q5QFB9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPPA-AS1Q5QFB9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPPA-AS1Q5QFB9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAPPA-AS1Q5QFB9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAPPA-AS1Q5QFB9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAPPA-AS1Q5QFB9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAPPA-AS1Q5QFB9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAPPA-AS1Q5QFB9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAPPA-AS1Q5QFB9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAPPA-AS1Q5QFB9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAPPA-AS1Q5QFB9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAPPA-AS1Q5QFB9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAPPA-AS1Q5QFB9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPPA-AS1Q5QFB9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPPA-AS1Q5QFB9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPPA-AS1Q5QFB9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPPA-AS1Q5QFB9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAPPA-AS1Q5QFB9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PAPPA-AS1Q5QFB9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPPA-AS1Q5QFB9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAPPA-AS1Q5QFB9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPPA-AS1Q5QFB9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAPPA-AS1Q5QFB9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAPPA-AS1Q5QFB9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAPPA-AS1Q5QFB9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPPA-AS1Q5QFB9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPPA-AS1Q5QFB9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPPA-AS1Q5QFB9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPPA-AS1Q5QFB9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PAPPA-AS1Q5QFB9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAPPA-AS1Q5QFB9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAPPA-AS1Q5QFB9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPPA-AS1Q5QFB9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPPA-AS1Q5QFB9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPPA-AS1Q5QFB9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAPPA-AS1Q5QFB9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAPPA-AS1Q5QFB9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPPA-AS1Q5QFB9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAPPA-AS1Q5QFB9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAPPA-AS1Q5QFB9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAPPA-AS1Q5QFB9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAPPA-AS1Q5QFB9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAPPA-AS1Q5QFB9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAPPA-AS1Q5QFB9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAPPA-AS1Q5QFB9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAPPA-AS1Q5QFB9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAPPA-AS1Q5QFB9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAPPA-AS1Q5QFB9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAPPA-AS1Q5QFB9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPPA-AS1Q5QFB9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPPA-AS1Q5QFB9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPPA-AS1Q5QFB9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAPPA-AS1Q5QFB9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAPPA-AS1Q5QFB9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAPPA-AS1Q5QFB9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAPPA-AS1Q5QFB9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms