Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHLRC3Q5JS37 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHLRC3Q5JS37 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHLRC3Q5JS37 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHLRC3Q5JS37 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHLRC3Q5JS37 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHLRC3Q5JS37 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHLRC3Q5JS37 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHLRC3Q5JS37 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NHLRC3Q5JS37 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHLRC3Q5JS37 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHLRC3Q5JS37 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NHLRC3Q5JS37 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHLRC3Q5JS37 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NHLRC3Q5JS37 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHLRC3Q5JS37 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHLRC3Q5JS37 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NHLRC3Q5JS37 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NHLRC3Q5JS37 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NHLRC3Q5JS37 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHLRC3Q5JS37 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NHLRC3Q5JS37 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHLRC3Q5JS37 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NHLRC3Q5JS37 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHLRC3Q5JS37 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHLRC3Q5JS37 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHLRC3Q5JS37 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHLRC3Q5JS37 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHLRC3Q5JS37 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHLRC3Q5JS37 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHLRC3Q5JS37 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHLRC3Q5JS37 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHLRC3Q5JS37 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHLRC3Q5JS37 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHLRC3Q5JS37 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHLRC3Q5JS37 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHLRC3Q5JS37 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHLRC3Q5JS37 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHLRC3Q5JS37 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHLRC3Q5JS37 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHLRC3Q5JS37 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHLRC3Q5JS37 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NHLRC3Q5JS37 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHLRC3Q5JS37 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHLRC3Q5JS37 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NHLRC3Q5JS37 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHLRC3Q5JS37 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHLRC3Q5JS37 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHLRC3Q5JS37 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHLRC3Q5JS37 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHLRC3Q5JS37 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHLRC3Q5JS37 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHLRC3Q5JS37 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHLRC3Q5JS37 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHLRC3Q5JS37 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NHLRC3Q5JS37 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHLRC3Q5JS37 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHLRC3Q5JS37 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHLRC3Q5JS37 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHLRC3Q5JS37 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHLRC3Q5JS37 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHLRC3Q5JS37 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHLRC3Q5JS37 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHLRC3Q5JS37 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHLRC3Q5JS37 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHLRC3Q5JS37 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHLRC3Q5JS37 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHLRC3Q5JS37 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHLRC3Q5JS37 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHLRC3Q5JS37 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHLRC3Q5JS37 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHLRC3Q5JS37 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHLRC3Q5JS37 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHLRC3Q5JS37 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHLRC3Q5JS37 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHLRC3Q5JS37 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NHLRC3Q5JS37 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NHLRC3Q5JS37 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHLRC3Q5JS37 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHLRC3Q5JS37 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHLRC3Q5JS37 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHLRC3Q5JS37 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHLRC3Q5JS37 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHLRC3Q5JS37 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHLRC3Q5JS37 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHLRC3Q5JS37 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHLRC3Q5JS37 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHLRC3Q5JS37 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHLRC3Q5JS37 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHLRC3Q5JS37 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NHLRC3Q5JS37 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHLRC3Q5JS37 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHLRC3Q5JS37 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHLRC3Q5JS37 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHLRC3Q5JS37 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHLRC3Q5JS37 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHLRC3Q5JS37 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHLRC3Q5JS37 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHLRC3Q5JS37 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NHLRC3Q5JS37 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms